產前檢測結果一大堆~該信哪一個?
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前言
近年來高通量測序技術的飛速發展,越來越多的染色體拷貝數異常在產前診斷中被發現,尤其是在染色體微小片段異常方面,主要包括染色體微缺失/重複。
目前,臨床上對染色體微缺失/重複大體上可分為良性可能、致病性可能以及意義不明確三類。
如何準確的檢測出孕婦腹中胎兒是否為染色體異常且明確其致病意義,這在產前診斷中尤為重要,從而可以輔助臨床正確指導妊娠,優生優育。
產前診斷是預防出生缺陷的最有效的手段,目前臨床上常用的染色體異常檢測技術有核型分析技術、螢光原位雜交技術(FISH)、螢光定量PCR、微陣列比較基因組雜交技術(基因晶片)、Bobs技術、高通量測序技術等,每一種技術都有其一定的局限性,臨床上很多時候是綜合2種或2種以上檢測技術來進行分析判斷。
表1 產前診斷檢測技術比較
今天小編通過一例臨床真實病例來對比分析多種檢測技術的染色體異常檢測的結果:
送檢者信息
年齡34歲,孕18周,孕2產1,唐篩高風險,檢測樣本為羊水
第一次檢測
Bobs+高通量測序+核型分析
醫院進行了常規核型分析和Bobs檢測,核型為G顯帶320條帶,Bobs為產前Bobs技術,在檢測的同時取5ml羊水送安諾優達進行NGS染色體異常檢測分析。
其中Bobs結果最先報出,結果陰性(圖1),
隨後10個工作日,安諾優達NGS染色體異常檢測結果顯示,Seq[GRCh37] del(7)(q11.23), 7號染色體長臂存在1.35M片段缺失(圖2)。
3周後,核型分析結果顯示正常(圖3)。
目前臨床醫生面前出現了三種檢測技術的不同結果(表2),為確定孕婦腹中胎兒是否有患染色體疾病的風險,因此決定進行再次驗證。
表2 三種檢測技術結果
第二次檢測
Bobs+高通量測序+FISH+基因晶片
經過與孕婦溝通,孕婦同意進行再次檢測,因為檢測的異常是染色體微小片段的缺失,所以本次檢測僅高通量測序和產前Bobs進行重複驗證,同時為了進一步驗證檢測結果,也同時進行FISH和基因晶片檢測。
第二次Bobs結果顯示仍是陰性(圖4);
隨後7個工作日,安諾優達NGS染色體異常檢測結果為陽性,仍然是Seq[GRCh37] del(7)(q11.23),7號染色體長臂存在1.35M片段缺失(圖5);
隨後FISH的檢測結果顯示,陽性,ish del(7)(q11.23q11.23)(圖6),與安諾優達NGS染色體異常檢測結果一致;
15天後,基因晶片檢測結果為arr[hg19] 7q11.23(72,650,120-74,141,494)×1(圖7),陽性,與FISH、安諾優達NGS染色體異常檢測結果一致。
最後匯總兩次檢測的全部結果如表3所示:
表3 最終檢測結果匯總
通過以上檢測結果的匯總對比分析,確認該孕婦腹中的胎兒7號染色體長臂存在1.35M片段缺失,該缺失片段與威廉士綜合徵(Wiliams-Beuren Syndrome)有關,臨床表現為智力障礙、主動脈狹窄、身材矮小、特殊面容、高鈣血症等。
最後與孕婦充分溝通,終止妊娠。
通過上面的這個案例可以發現,臨床上的檢測技術每一種都有其特點,但是也都有其局限的地方(見表1),如核型分析雖然覆蓋全部染色體,但是解析度較低;FISH技術在產前診斷中經常作為補充的驗證技術來使用,並且FISH探針主要是面對臨床常見的幾種染色體疾病,所以無法覆蓋所有的染色體異常,如果面對新的染色體異常情況,需要重新定製探針;微陣列晶片技術(基因晶片)自推出以來一直受到了臨床工作者的歡迎,但是目前價格較高,同時由於其檢測原理的限制,無法檢測新發突變,並且還存在探針密度不均勻等問題,因此無法大規模的臨床應用;Bobs檢測技術是目前產前診斷技術裡面速度最快的技術,但由於在產前診斷中只覆蓋了部分染色體異常,易出現漏診情況,因此對臨床指導有限。
高通量測序技術是目前發展最迅速的檢測技術,目前高通量測序廣泛應用於臨床和科研中,經過上面的案例可以發現,在產前診斷中高通量測序也可以有效的檢測出微小片段的異常,相信經過一段時間的應用與推廣,高通量測序可以在產前診斷中發揮越來越大的作用。
安諾優達NGS染色體異常檢測
可有效彌補核型分析技術精度不足的缺點,檢測全部23對染色體的數目異常及0.1Mb以上微缺失/微重複。
可用於》自然流產、反覆流產
》不孕不育
》成年人/未成年人智力異常/發育遲緩
》產前胎兒影像學異常
等問題的遺傳學原因排查 。
NextSeq 550AR
是安諾優達與美國Illumina公司合作開發的新一代桌面式高通量基因測序儀,採用最新研發的雙通道「邊合成邊測序(SBS)」技術和經典的「可逆末端終止子」專利技術,具有通量高、速度快、數據精準、性能穩定、操作簡單等諸多優勢,與目前市面現有的設備比較,其數據質量、穩定性以及批量樣本處理能力等均具有顯著領先的優勢。
同時, NextSeq
550AR也具備極強的臨床和學術應用延展性,包括PGS、液體活檢、FFPE測序、遺傳病檢測等都可以在此測序平台上進行試劑盒的開發和註冊。
關於安諾優達
安諾優達總部位於北京,是中國基因組行業的知名企業、亞洲一流的醫學基因組中心、國家發改委首批基因檢測技術應用示範中心、國家衛計委首批高通量測序臨床應用試點單位、國家高新技術企業、北京市發改委「精準醫療與基因工程北京市工程實驗室」、「十三五」時期首批北京生物醫藥產業跨越發展工程(G20工程)企業、中關村高新技術企業、中關村新銳十強企業、中國最具投資價值企業、2016中國最具科技引領力企業,擁有博士後科研工作站。
公司專注於新一代基因組學技術在人類醫學健康和生命科學研究兩大領域的產業化應用,建立了領先的高通量測序平台和高性能計算平台,並先後與美國 Illumina公司和阿里雲達成戰略合作,研發了最先進桌面式高通量測序儀NextSeq 550AR以及搭建基因大數據分析雲平台安諾雲,形成了強大的Bio-IT 基礎和產業化服務能力。
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