產前診斷中的微缺失微重複概念

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染色體微缺失、微重複綜合徵是由微小的、經過傳統細胞遺傳學分析難以發現的染色體畸變而導致的具有複雜臨床表現的遺傳性疾病。


畸變小於5Mb,基因組中最常見的類型

目前發現至少67種類型,發病率1/4000~1/50000

臨床表型:生長發育異常 智力發育遲緩 特殊面容 內臟器官畸形 內分泌異常 精神行為改變

遺傳特點

新發:85~95%

家族遺傳5-10%遺傳方式 常染色體顯性遺傳

檢測方法:FISH Q~PCR Array CGH/SNP Array

對症治療 預後差

發生機制:

低拷貝重複序列 缺失 重複

真核生物的基因組相當於基因的一股由只有一個複製DNA序列(也稱單一DNA,unique sequence,single copy sequence,nonrepetitive sequence等)和具有多數反覆存在的DNA順序組成。

稱後者為重複順序。

染色體上存在的大量無轉錄活性的重複DNA序列。

其組織形式有兩種:串聯重複序列;分散重複序列。

前一種成簇存在於染色體的特定區域,後一種分散於染色體的各位點上。

類型:高度重複序列 單拷貝序列 低度重複序列 中度重複序列

常規核型分析難以發現5Mb以下的染色體缺失和重複,因而局限較大。

FISH技術比核型分析具有更高的靈敏度和特異性,但也只能作為特定目標疾病或針對性排除某種疾病的診斷情況下使用,若作為多種染色體微缺失微重複的篩查技術,FISH明顯不足,費時費力且成本很高。

包含SNP Array和Array CGH在內的晶片技術對於染色體微缺失微重複具有很好的應用,但同樣作為多種染色體微缺失微重複的篩查時,高昂的檢測成本成為臨床應用的掣肘。

更為重要的一點,上述三種檢測技術均為侵入式,檢測樣本需為羊水或絨毛膜,存在流產風險。

基於高通量測序技術的NIPT,已被證實對於包括T21、T18、T13在內的染色體非整倍體檢測真實可靠。

全基因組覆蓋、低檢測成本和非侵入性取樣,使得染色體微缺失微重複成為下一個NIPT臨床轉化的熱點。

眾多針對染色體微缺失微重複的NIPT臨床研究也為這一熱點給出了肯定的答案。

SNP array 全基因組拷貝分析+FISH驗證的染色體微缺失微重複檢測技術平台檢測常規染色體分析不能診斷的異常


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