酵素活性分析
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(2) 酵素活性單位(unit),指在單位時間(通常為分鐘)內,酵素使受質減少(或產物增加)的量。
受質減少(或產物增加)的量,可視實驗的需求或方便性,以莫耳 ...
酵素活性分析
一、Beer’s
law
二、抽出液中含有的酵素活性單位
三、酵素-催化反應的反應速率單位
四、酵素活性問題及解答
一、Beer’s
law
若某一化學物質可吸收某一波長的光
(如H2O2可吸收波長240
nm的光),則該化學物質在溶液中的濃度,會與溶液對該波長的吸光值(absorbance)成一正比關係,因此利用分光光度儀(spectrophotometer)
測定吸光值後,即可推知該化學物質在溶液中的濃度。
化學物質在波長l的吸光值(Al;
absorbance)定義為Al
=log(I0/I)。
吸光值另稱為optical
density(OD)。
吸光值(或OD值)
只為一個數值,並無單位。
I0(incidentlightdensity):
為分光光度儀所放出波長l的光束強度。
I
(transmittedlightintensity):為I0經過溶液及石英管後,所穿透出的光束強度
化學物質在波長l的吸光值(Al)與下列兩項因子成一正比關係:
(1)
化學物質在溶液中的濃度
(C;單位:
M或mg/ml
等)。
(2)
所用石英管(cuvette)的寬度(l;
單位:cm
)。
此正比關係稱為Beer’s
law(或Beer-Lambert
law):即Al
=
el
Cl
el:為一比例常數(proportionality
constant),稱為該化學物質在波長l的extinction
coefficient,單位為
mM-1cm-1或liter
mol-1cm-1等。
el
可經由實驗求得,即先配製不同濃度的化學物質,在波長l及固定寬度的石英管中,測定吸光值,即可依實驗所得的數據,求得el。
例如,H2O2在波長240
nm的el
=0.0395mM-1cm-1。
二、抽出液中含有的酵素活性單位:
抽出液中含有多種蛋白質,這些蛋白質中,有些則具有某些酵素活性。
例如,種子抽出液中,含有多種酵素,其中有一種即為a-amylase。
抽出液中,某一種酵素含有多少量,通常以實際的酵素活性表示,常用的單位有兩種:
(a)以units/ml表示,即1
ml的抽出液中含有多少unit
(單位)的該種酵素活性。
(b)以unit/mg表示,即抽出液中,每1
mg的蛋白質含有多少unit
(單位)的該種酵素活性,此表示方法,稱為抽出液中所含有該酵素的比活性(specific
activity)。
對某一酵素而言,抽出液的比活性愈高,則抽出液含有該酵素的純度愈高。
(2)酵素活性單位(unit),指在單位時間(通常為分鐘)內,酵素使受質減少(或產物增加)的量。
受質減少(或產物增加)的量,可視實驗的需求或方便性,以莫耳(mole)、克(g)、OD吸光值等表示。
例如:
1unit可表示在一分鐘內,可使受質減少(或產物增加)
1mmole;亦可表示為在一分鐘內,可使受質減少(或產物增加)
1mg;或可表示為在一分鐘內,可使受質的OD吸光值減少0.1
(或是0.01等等)。
例如:
O.D.值變化量
活性
=
(樣品蛋白質含量)
X(反應時間-分鐘)
三、酵素-催化反應的反應速率單位:
酵素反應的速率,以最初反應速率(initial
velocity)表示,單位為mmoles/min,亦可以mmoles/liter-min表示。
在適當條件[適當溫度、pH
值、及離子強度(ionic
strength)等],且酵素的受質量很足够
(即最初的受質濃度大於酵素濃度時)的情況下,加入一定量的酵素溶液,則在不同時間後,受質的減少量(或產物的增加量)呈現如下列的圖形中的曲線。
在曲線上的每一點的切線(如圖中的1,
2,3)的斜率,為在該時間的反應速率。
因此,在同一個最初的受質濃度,若取不同時間點,則會有不同的反應速率。
通常在特定的最初受質濃度下,酵素反應的速率,均以最初反應速率(initial
velocity;即酵素反應開始進行時的速率)表示。
因此,在曲線上取的點,若越接近原點,則該點的切線的斜率,越接近最初反應速率,如下圖中,切線1的斜率可視為酵素在某一最初受質濃度之下的最初反應速率。
四、酵素活性問題及解答:
植物組織抽出液,經蛋白質定量後,抽出液含有20
mg/ml的蛋白質。
在反應體積為0.5
ml,內含10
ml抽出液,以測定抽出液中酵素A的活性。
在適當條件下[適當pH
值、離子強度(ionic
strength)、所有受質為飽和濃度等],酵素A一分鐘內,可催化產生3
mmoles
產物。
請計算:
(1)酵素-催化反應的最初反應速率(initial
velocity),
(1-1)以mmoles/liter-min
表示。
(1-2)以mmoles/min
表示。
(1-3)如在標準反應體積1.0
ml下,取10
ml萃取液進行反應,則反應速率為多少
mmoles/liter-min。
(2)抽出液中酵素活性(enzymatic
activity):
(2-1)抽出液的酵素A活性,以units/ml
表示,
(2-2)抽出液的酵素A的比活性,以unit/mg
protein表示。
解答:
(1)
酵素-催化反應的最初反應速率:
(1-1)
以mmoles/liter-min
表示。
n
=(3mmoles/min)/0.5
ml=(3mmoles/min)/0.5
´10-3
liters
=3/(0.5´10-3)
mmoles/liters-min
n
=6´103
mmoles/liters-min
(1-2)
以mmoles/min
表示。
n
=3mmoles/min
(1-3)
如在標準反應體積1.0
ml下,取10
ml萃取液進行反應,則反應速率為多少mmoles/liter-min。
n
=(3mmoles/min)/1.0
ml=(3mmoles/min)/1.0
´10-3
liters
=3/(1.0´10-3)
mmoles/liters-min
n
=3´103
mmoles/liters-min
或可以下列方法計算:
因反應總體積加倍,造成酵素濃度減半,因此反應速率(mmoles/liter-min)
將減半。
所以
n
=(3mmoles/min)/1.0
ml=(3mmoles/min)/1.0
´10-3
liters
=(6´103
mmoles/liters-min)/2
n
=3´103
mmoles/liters-min
當反應體積增加時,產物總量依然不變。
雖然mmoles/liter-min
的反應速率減半但反應總體加倍。
因所有的反應均在受質的飽和濃度下進行,每一反應的反應速率為Vmax
值。
(2)
抽出液中酵素活性(enzymaticactivity):
(2-1)
抽出液的酵素A活性,以units/ml
表示,
1unit
定義:在適當反應條件下,每分鐘催化產生1
mmoles
產物所需的酵素量。
因此,反應速率3
mmoles/min
相當於3
units。
以10
ml
萃取液產生3
units,
酵素A活性=
3units/10ml
=3units/0.01ml
酵素A活性
=300units/ml
(2-2)
抽出液的酵素A的比活性,以unit/mg
protein表示。
比活性(specific
activity)定義:每毫克(mg)
蛋白質所含酵素units。
比活性=(300
units/ml)/(20mgprotein/ml)
比活性=15
units/mgprotein
含有catalase的蛋白質溶液中,含有蛋白質的濃度為
0.5mg/ml,取
200ml至H2O2溶液中,使最後測試溶液的總体積為1
ml,並以分光光度儀(spectrophotometer)
測定OD240。
一開始測的OD240
=0.1,經過一分鐘後,OD240
降至
0.054,請求出含有catalase的蛋白質溶液的catalase的比活性
(mmol/min/mg)。
(石英管的寛度為1
cm;H2O2在波長240
nm的el
=0.0395mM-1cm-1)。
註:
1.catalase
催化以H2O2為還原劑,將H2O2還原成H2O的反應:
H2O2+H2O2->
O2+2H2O。
2.
含有酵素的蛋白質溶液的比活性(specificactivity),以unit/mg表示,
即溶液中,每1
mg的蛋白質含有多少酵素活性單位(unit)。
3.酵素活性單位(unit),指在單位時間(通常為分鐘)內,酵素使受質減少(或產物增加)的量,
單位可為
mol/min。
解答:
1.以Beer’s
law(Al
=el
Cl)計算一分鐘之內,測試溶液中受質(H2O2)的減少量:
(1)一分鐘內OD減少值:0.1-0.054
=0.046
∵Al
=el
Cl
∴0.046=
0.0395(mM-1cm-1)´C´1(cm)
C=0.046/0.0395(mM-1)=1.165mM
∴一分鐘內受質(H2O2)減少1.165
mM
(2)
測試溶液總體積為1ml
1.165(mM)
´1
(ml)=[1.165´10-3
(M)]´[1´10-3
(L)]
=1.165
´10-6mole
=1.165mmole
∴
一分鐘內受質(H2O2)減少1.165
mmole
∴
酵素活性單位(unit)=
1.165
mmole/min
2.
計算測試溶液中蛋白質的含量:
0.5
(mg/ml)´200
(ml)=0.5(mg/ml)´0.2
(ml)=0.1mg
∴
溶液中含有蛋白質0.1
mg
3.
計算溶液的catalase的比活性:
比活性(unit/mg)
=1.165(mmole/min)/0.1
(mg)=11.65mmole/min/mg
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