轉錄因子結合位點突變與基因表現量於藥物反應之關聯性研究

轉錄因子 ； 單一核苷酸多態性 ； 基因表現量的差異 ； 去氧核醣核酸定序 ； 核糖核酸定序 ； 轉錄因子結合位點 ； Transcription Factor ； Single Nucleotide ... 隨時查．隨時看，你的隨身圖書館已上線! 立即使用 DOI 是數位物件識別碼 （ D igital O bject I dentifier ） 的簡稱， 為物件在網路上的唯一識別碼，可用於永久連結並引用目標物件。

使用DOI作為永久連結 每個DOI號前面加上 「 http://dx.doi.org/ 」 便成為永久網址。

如以DOI號為 10.5297/ser.1201.002 的文獻為例，此文獻的永久連結便是： http://dx.doi.org/ 10.5297/ser.1201.002 。

日後不論出版單位如何更動此文獻位置，永久連結所指向的位置皆會即時更新，不再錯失重要的研究。

引用含有DOI的文獻 有DOI的文獻在引用時皆應同時引用DOI。

若使用APA、Chicago以外未規範DOI的引用格式，可引用DOI永久連結。

DOI可強化引用精確性、增強學術圈連結，並給予使用者跨平台的良好使用經驗，目前在全世界已有超過五千萬個物件申請DOI。

如想對DOI的使用與概念有進一步了解，請參考 華藝DOI註冊中心 （ doi.airiti.com ） 。

來源資料 中正大學資訊工程學系學位論文 碩士班/2014年 EvolutionaryAlgorithmsforSelectability,Latency,andDynamicsinPickupandDeliveryProblem 於次世代網路邊緣佈建媒體無關資訊服務 轉錄因子結合位點突變與基因表現量於藥物反應之關聯性研究 WeOSAndroid開發工具包 Quality-BasedFullAngleCoverageforObjectTrackinginVisualSensorNetworks SoftwareTransactionalMemoryinaDynamicProgrammingLanguageatVirtualMachineLevel 基於CCA與PrincipleAngles之動作辨識 手持裝置新聞訂閱系統實作 使用深層信念網路分類音樂情緒 使用單一彩色攝影機與三維模型的手部姿勢估測方法 基礎與應用科學 > 資訊科學 工學院 > 資訊工程學系 書目管理工具 書目匯出 加入收藏 E-mail給朋友 列印書目 相關連結 問題回報 目前無全文，華藝徵求您的同意授權。

我要授權 轉錄因子結合位點突變與基因表現量於藥物反應之關聯性研究 AStudyofSNPsinTranscriptionFactorBindingSitesandGeneExpressioninDrugResponse 沈峻 ,碩士　　指導教授：黃耀廷　　 英文 轉錄因子；單一核苷酸多態性；基因表現量的差異；去氧核醣核酸定序；核糖核酸定序；轉錄因子結合位點；TranscriptionFactor；SingleNucleotidePolymorphism；Differentialexpressiongene；DNA-Seq；RNA-Seq；TranscriptionFactorBindingSites 分享到 摘要 │ 參考文獻 (16) │ 文章國際計量 摘要 〈TOP〉 由於大規模平行定序技術之成本與產量逐年改善，此技術已廣泛用在全基因體關聯性疾病研究中。

其中核醣核酸定序(RNA-Seq)可用來尋找病例組和對照組之間表現量有差異之基因，稱為差異表現基因(DifferentialExpressionGene)。

然而基因表現量是藉由轉錄因子(TranscriptionFactor)黏到去氧核醣核酸上特定的序列來調控，此特定序列亦稱為轉錄因子結合位點(BidingSite)。

若轉錄因子結合位點上發生突變，將可能會造成基因表現量往上或往下調控。

在這篇論文，我們結合去氧核醣核酸定序技術(DNA-Seq)、核糖核酸定序技術(RNA-Seq)，以及染色質定序(Chromatin-Seq)，尋找出位於轉錄因子結合位點上，且可能影響基因表現量之單一核苷酸多態性(SingleNucleotidePolymorphism)。

在轉錄因子結合位點內可能調控的單一核苷酸多態性(SNP)。

結合轉錄因子資料庫和所設計之方法，結果顯示尋找出的結合位點突變，會改變多數差異表現基因之表現量。

而其他表現量無差異之基因，缺少這種結合位點突變。

這些可能有影響表現量之單一核苷酸多態性，可透過生物實驗做更進一步確認。

並列摘要 〈TOP〉 Massiveparallelsequencinghasbecomeapopularplatformforgenome-wideassociationstudies.AnumberofstudieshaveusedRNA-seqforcomparinggeneexpressionprofilesbetweentreatmentandcontrolgroupsandidentifyingdifferentialexpressiongene(DEG).Geneexpressionisregulatedbytranscriptionfactors(TFs)whichbindonaspecificsequencecalledTranscriptionFactorBindingSite(TFBS).Theexpressionlevelmaybeup-ordown-regulatedduetoSNPsintheTFBS.Inthisthesis,weintegrateDNA-seq,RNA-seq,andchromatinsequencingtoidentifyriskSNPswouldmayup-/down-regulateexpressionofgenesbetweencaseandcontrolgroups.ThepotentialregulatorySNPswithinTFBSareidentifiedviaintegrationofTFdatabaseandcomputationalmethods.TheexperimentalresultsindicatethatmanyDEGspossessedriskSNPsinTFBS,whereasthegeneswithoutchangeofexpressionhavelessSNPSoccurredinTFBS.Thus,theseriskSNPsareworthofvalidationbysubsequentwet-labexperiments. 參考文獻 ( 16 ) 〈TOP〉 1. Dalca,A.V.andM.Brudno,Genomevariationdiscoverywithhigh-throughputsequencingdata.BriefingsinBioinformatics,2010.11(1):p.3-14.連結： 2. Mardis,E.R.,Theimpactofnext-generationsequencingtechnologyongenetics.TrendsinGenetics,2008.24(3):p.133-141.連結： 3. Shendure,J.,etal.,Advancedsequencingtechnologies:Methodsandgoals.NatureReviewsGenetics,2004.5(5):p.335-344.連結： 4. Voelkerding,K.V.,S.A.Dames,andJ.D.Durtschi,Next-GenerationSequencing:FromBasicResearchtoDiagnostics.ClinicalChemistry,2009.55(4):p.641-658.連結： 5. Kim,J.andD.P.Bartel,Allelicimbalancesequencingrevealsthatsingle-nucleotidepolymorphismsfrequentlyaltermicroRNA-directedrepression.NatureBiotechnology,2009.27(5):p.472-477.連結： 文章國際計量 〈TOP〉 E-mail ： 文章公開取用時，將寄通知信至您填寫的信箱地址 E-mail ： 購物車中已有多篇文章，請問是否要先清除，或一併加入購物車中購買?