Difference between C57BL/6J and C57BL/6N - 清华大学实验 ...
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2、Crb1rd8突变:C57BL/6N是Crb1rd8突变(视网膜变性8突变)的纯合子,可在眼底观测到由视网膜折叠和假菊形团形成的感光器退化的斑点;C57BL/6J无该突变。
3. Nnt基因:C57BL ...
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提到C57BL/6小鼠,大家都不会陌生,它的历史可以追溯到1921年C.C.Little对MissAbbyLathrop品系(C57BR和C57L也源于该品系)的交配繁育;在1937年又分离出了6号系和10号系;而在1948年,Jackson实验室从Hall引入6号系,培育出C57BL/6小鼠。
1951年,引入NIH。
经过多年繁育,C57BL/6形成了两个主要的亚系:C57BL/6J与C57BL/6N。
目前,这两个亚系在全球多个生产单位保种,而且都已繁育220代左右,广泛应用于基因工程鼠的制作、免疫学、行为学、代谢机制、老龄鼠等方面的研究。
实际上,从基因型到表型,不同亚系间是存在一定程度差异的。
我们在选择实验动物的时候,也需要重视不同亚系之间的差异,那么6N和6J这两个常见亚系之间究竟有哪些不同呢?
1、基因序列差异:编码区内有34个SNPs差异,2个核苷酸碱基的缺失,15个与基因相关的结构变异体(MichelleMS.etal.2013)。
2、Crb1rd8突变:C57BL/6N是Crb1rd8突变(视网膜变性8突变)的纯合子,可在眼底观测到由视网膜折叠和假菊形团形成的感光器退化的斑点;C57BL/6J无该突变。
3.Nnt基因:C57BL/6J由于碱基缺失突变导致无Nnt基因(烟酰胺核苷酸转氢酶),而C57BL/6N不存在Nnt基因缺失。
Nnt基因与葡萄糖代谢相关。
若进行代谢机制方面的研究,需明确这一点(Freeman,H.C.etal.2006)。
4.Cyfip2M1N突变:C57BL/6N是Cyfip2M1N突变的纯合子(此突变导致细胞质FMR1相互作用蛋白2在968位点由苯丙谷氨酸代替丝氨酸),突变降低可卡因对动物的应激反应(以运动活跃度测量)约45%左右;C57BL/6J无该突变。
5.Nlrp12突变:C57BL/6N中Nlrp12的突变导致富亮氨酸重复域C末端1034位氨基酸由亮氨酸变为精氨酸,影响未知。
6.免疫学方面:Envigo(原HarlanSpragueLaboratories)C57BL/6NHsd亚系含有自发性Dock2突变,导致其免疫表型发生变化:外周B细胞缺失、记忆性CD8T细胞增多,从而影响免疫学研究;但其它C57BL/6亚系(包括C57BL/6J、C57BL/6NJ、C57BL/6Ncrl、C57BL/6NTac)没有发生该突变(VinayS.Mahajan.etal.2016)。
7.领地意识:C57BL/6N雄性小鼠领地意识要强于C57BL/6J小鼠,性成熟后更易出现因为争抢领地而导致的打斗现象。
8.生理异常:C57BL/6J雌性小鼠的剃毛、掉毛现象要高于C57BL/6N小鼠。
C57BL/6J雌性小鼠出现阴道纵膈的比例为4%-11.3%,而C57BL/6N雌性小鼠阴道隔比例很低,小于1%(Gearhart,S.etal.2004)。
总结如下表:
项目(基因序列差异)
C57BL/6N
C57BL/6J
备注
Crb1rd8
突变,纯合子
无突变
Nnt基因
有此基因
碱基缺失造成无此基因
Nnt为烟酰胺核苷酸转氢酶基因与葡萄糖代谢相关
Cyfip2M1N突变
突变,纯合子
无突变
突变降低可卡因对动物的应激反应约45%
NIrp12突变
突变,纯合子
无突变
突变导致亮氨酸变为精氨酸
免疫性能
6NHsd亚系自发性Dock2突变,造成外周B细胞缺失记忆性CD8T增多
无突变
其他亚系也无突变
领地意识
6N雄性强
6J雄性弱
N雄性领地意识强于J,性成熟后更易打斗
生理异常
6N雌性低
6J雌性高
6J雌雄小鼠剃毛、掉毛现象高于6N
提示:
1.N即NIH,J即Jackson;
2.维通利华供应两个亚系:C57BL/6NCrl(CharlesRiver)和C57BL/6JCnc(中国国家啮齿类实验动物种子中心)
以下摘录只JAX网站,修改如下:NotallC57BL/6micearethesame:It'swhat'sontheinsidethatcounts…
C57BL/6orB6micearethemostcommonlyusedinbredmiceinbiomedicalresearch.TwoofthemostcommonsubstrainsusedtomakegenetargetedmousemodelsareC57BL/6J(J=Jackson)andC57BL/6N(N=NIH).Althoughmicefrombothsubstrainsappearblack,theydiffergeneticallybysinglenucleotidepolymorphisms(SNPs),insertionsanddeletions(Indels),copynumbervariations(CNVs)and/orspontaneousmutations.Thesegeneticdifferencescantranslateintophenotypicdifferencesthatcanaffectproperlyinterpretingandreproducingyourresearchresults.Phenotypicdifferenceshavespecificallybeennotedinthefieldsofneurobiology(behavior,vision,hearing),metabolism,andimmunology,tonameafew.
ForExample:
NeurologicalDifferences:
MiceontheC57BL/6NgeneticbackgroundcarrytheCrb1rd8mutation,causingprogressive,spottyretinaldegenerationinmice.TheC57BL/6Jstraindoesnotcarrytherd8mutation.UsingmicewiththeB6Nbackgroundcaninterferewithyourexperimentsifyourmicearerequiredtointerpretvisualcuesorifyouaretryingtocharacterizeanewmutationthatisexpectedtoaffectvision.
MetabolicDifferences:
C57BL/6JmicehaveamutationintheNntgenewhichmayaffectmetabolismduetoinappropriateglucosehomeostasisinB6Jmice.C57BL/6Nlinesdonothavethismutation.InlookingintotheeffectoftheNntalleleondietinducedobesity(DIO)responsiveness,C57BL/6JmaleshadasignificantlymorerobustDIOresponse(higherweightgain,moreadiposity,andmoresevereimpairedglucosetolerance)thanC57BL/6Nmales.
ImmunologicalDifferences:
InresponsetothebacterialinfectionListeriamonocytogenes,C57BL/6JshowsgreatersusceptibilitytoListeriasppwhileC57BL/6Nshowsasignificantpro-inflammatoryresponse.Also,whenbothsubstrainswerechallengedwithdinitrofluorobenzene,C57BL/6JshowedagreaterinflammatoryresponsecomparedtoC57BL/6N.
SowhichB6substrainisrightforyourresearch?ingenioushasthesolution!
Asthedifferencebetweenthetwomainsubstrainsbecameevident,ingenioustargetinglaboratoryadaptedtothesefindingsbydevelopinga50:50mixofNandJwhereoneallelecomesfromtheNsubstrain,andtheothercomesfromtheJsubstrain.Fromthis,wecanmatetheresultingchimerastothedesiredpuresubstrainforyourresearchandsubsequentlygenotypeforthelossofthemutation.Wearethusabletodelivermicethatarenotonlygermlineconfirmedforthedesiredknockoutorknockin,butalsonegativefortheunwantedmutation.
IngeniousC57BL/6celllinesuccessstory
IngeniouswasthepioneeringcompanytooffergenetargetingintheC57BL/6strainin2004andwehavegeneratedhundredsofmodelsinthepureB6strain.Allourembryonicstemcellstrains,includingtheC57BL/6linesarehighlyrobust,consistentlyshowinga>90%euploidyratecomparedtothe70%industrystandard.Over1,400mousemodelsandtargetedmouseembryonicstemcelllineshavebeendeliveredfromingeniousEScelllines.
References:
1.JacksonLaboratorywebinar-Protectyourresearch:KnowyourB6mouse.
2.Mehalow,AKetal.2003.Hum.Mol.Genet.12(17):2179-2189.
3.Leiter,EH.2008.DoesamutantNADnucleotidetranshydrogenase(Nnt)geneinC57BL/6Jimpairresponsivenesstodiet-inducedobesity?TheJacksonLaboratory.
4.Simon,MMetal.2013.GenomeBiology.14:R82
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