信使核糖核酸- 维基百科,自由的百科全书 - Wikipedia
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信使核糖核酸(英语:messenger RNA,缩写:mRNA),是由DNA经由转录而来,带着相应的遗传讯息,为下一步翻译成蛋白质提供所需的讯息。
在细胞中,mRNA从合成到被降解, ...
信使核糖核酸
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mRNA在真核细胞中的交互作用。
Pre-mRNA经由转录被创造出来;在经过增加5'端帽、剪接和加上多聚腺苷酸尾链之后成为mRNA,被运送到细胞质,然后由核糖体进行翻译产生蛋白质。
信使核糖核酸(英语:messengerRNA,缩写:mRNA),是由DNA经由转录而来,带着相应的遗传讯息,为下一步翻译成蛋白质提供所需的讯息。
在细胞中,mRNA从合成到被降解,经过了数个步骤。
在转录的过程中,第二型RNA聚合酶(RNApolymeraseII)从DNA中复制出一段遗传讯息到前mRNA(尚未经过修饰或是部分经过修饰的mRNA,英文pre-messengerRNA,简称pre-mRNA,或是heterogeneousnuclearRNA,简称hnRNA)上。
在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA并未被进一步处理(但有些罕有的特例),而经常是边转录边翻译。
在真核生物中,转录跟翻译发生在细胞的不同位置,转录发生在储存DNA的细胞核中,而翻译是发生在细胞质中。
不过,曾有研究学者认为真核生物亦有边转录边翻译的现象[1],只是这个观点未被广泛接受。
目录
1转录后修饰
2非编码区/未翻译区
3mRNA密码子与氨基酸的对应
4反义RNA(anti-senseRNA)
5参考文献
6参见
转录后修饰[编辑]
主条目:转录后修饰
在真核生物中,mRNA在准备好翻译前需要经过多个处理步骤:
首先pre-mRNA需要加上一个5'端帽(capping)--经过甲基化(methylation)修饰的鸟嘌呤被加到mRNA的3'端。
这个5'端帽对于mRNA运输到细胞质并与之后接到适当的核糖体,以及mRNA本身的稳定是相当重要的。
mRNA如果缺乏5'端帽,则很容易就被降解掉。
而mRNA由5'到3'的降解亦是由移除5'端帽开始。
mRNA剪接(mRNAsplicing)--mRNA前体去除掉内含子而保留外显子的修饰过程。
通常mRNA前体能经由数种不同的剪接方式,产生不同组态/型式的mRNA,使一段基因在不同的组织或发育过程中能经过转录-剪接-翻译后产生不同型式的蛋白质,进而拥有不同的作用,或是产生出稳定性差的mRNA达到调控基因表达的目的。
这种剪接型态叫做选择性剪接。
绝大部分mRNA的剪接都是由剪接体所执行,只有少数例外,例如histonemRNA没有内含子,但是其pre-mRNA却需要经由另外的剪接方式才能产生成熟mRNA[2]。
以上所述为分子内剪接(cis-splicing),而mRNA剪接作用亦可发生在不同mRNA分子之间(trans-splicing),后者常见于原生生物的mRNA剪接[3]。
除了mRNA之外,有些RNA分子也有能力催化自身的修剪,例如核酸酶会做自我切除,而第I或第II型外显子在特殊环境下可以不借由蛋白质酵素的作用而进行剪接,称为自剪接作用。
多聚腺苷酸化(polyadenylation)--借由酵素多聚腺苷酸聚合酶(poly(A)+polymerase),在mRNA前体的3'端上加上了一段数个腺嘌呤序列(通常是数百个),(这项修饰并不会出现在原核生物中)。
这段多聚腺苷酸尾链在转录的时候,会因为mRNA上一段特殊的讯息,AAUAAA,而在mRNA后方特定位置上加上多聚腺苷酸尾链。
多聚腺苷酸尾链会被多聚腺苷酸结合蛋白(poly(A)+tail-bindingprotein,PABP)辨识并保护住。
这段AAUAAA讯号的重要性可以从以下这个例子看出:当要转录时,DNA分子上的AATAAA片段如果产生突变,将会导致某些血红素缺陷[4]。
另外,对于部分histonemRNA而言,此过程是不被需要的[2]。
改变tRNA对mRNA上密码子的识别,更可能改变了蛋白质上氨基酸的组成。
多聚腺苷酸化(polyadenylation)能增加转录的半生期,使得mRNA在细胞中的存在时间能延长得久一些,因此能再翻译出更多的蛋白质。
在pre-mRNA在被修饰过之后(包含RNA剪接及加上5'端帽与3'端上多聚腺苷酸尾),形成成熟的mRNA,从而可准备进行翻译。
成熟mRNA从细胞核被送出到细胞质中,然后核糖体结合在其上,开始翻译出蛋白质[5]。
随着时间进行,mRNA的多聚腺苷酸尾会被专门的外切核酸酶缩短,而5'端帽也可能被除去,使得该聚合物易受到核酸外切酵素的影响而被降解[6]。
成熟真核细胞的mRNA的结构。
一个完整的mRNA包括有5'端帽、5'非翻译区、编码区、3'非翻译区和poly(A)尾链。
非编码区/未翻译区[编辑]
在RNA起始密码子之前,与终止密码子(stopcodon)之后,各有一段非编码区,各被称作5'UTR与3'UTR,(5'与3'非编码区,因为DNA与RNA分子都是由5'端到3'端,也就是说这些区域是在RNA分子的两端)是属于不翻译出蛋白质的序列。
然而,这些区域的重要性在于它们的序列有可能借由这些区域与不同的RNA结合蛋白(RNA-bindingprotein)结合,进而改变在细胞中的位置、决定mRNA的稳定性/半生期,以及对细胞受到刺激时的反应而生的翻译调控。
这些都是与细胞调控本身的活性有关。
在UTRs上的某些蛋白质复合物不仅能影响RNA的稳定度,也能促进翻译效率或是抑制翻译,这多是依据位在UTRs上的序列而定。
有些在UTR上的基因遗传的变异也会造成上述的RNA稳定度或是翻译效率的改变。
[7]
一些包含在UTRs的功能性序列,常能形成一些有特性的二级结构,这些造成二级结构也牵扯到调节mRNA本身。
某些序列,像是SECIS,是蛋白质结合区[来源请求]。
其中一类的mRNA元素,riboswitches,能直接结合上小分子,改变了mRNA自身的折叠结构,也影响了转录或是翻译作用[来源请求]。
另外,有些mRNA的3'UTR含有AU-richelemnet(ARE),能影响到mRNA的半生期[来源请求]。
换句话说,mRNA分子可以进行自我调控。
mRNA密码子与氨基酸的对应[编辑]
氨基酸生化性质
非极性
极性
碱性
酸性
终止密码子
标准遗传密码
碱基1
碱基2
碱基3
U
C
A
G
U
UUU
(Phe/F)
苯丙氨酸
UCU
(Ser/S)
丝氨酸
UAU
(Tyr/Y)
酪氨酸
UGU
(Cys/C)
半胱氨酸
U
UUC
UCC
UAC
UGC
C
UUA
(Leu/L)
亮氨酸
UCA
UAA[B]
终止(赭石)
UGA[B]
终止(蛋白石)
A
UUG
UCG
UAG[B]
终止(琥珀)
UGG
(Trp/W)色氨酸
G
C
CUU
CCU
(Pro/P)
脯氨酸
CAU
(His/H)
组氨酸
CGU
(Arg/R)
精氨酸
U
CUC
CCC
CAC
CGC
C
CUA
CCA
CAA
(Gln/Q)
谷氨酰胺
CGA
A
CUG
CCG
CAG
CGG
G
A
AUU
(Ile/I)
异亮氨酸
ACU
(Thr/T)
苏氨酸
AAU
(Asn/N)
天冬酰胺
AGU
(Ser/S)
丝氨酸
U
AUC
ACC
AAC
AGC
C
AUA
ACA
AAA
(Lys/K)
赖氨酸
AGA
(Arg/R)
精氨酸
A
AUG[A]
(Met/M)
甲硫氨酸
ACG
AAG
AGG
G
G
GUU
(Val/V)
缬氨酸
GCU
(Ala/A)
丙氨酸
GAU
(Asp/D)
天冬氨酸
GGU
(Gly/G)
甘氨酸
U
GUC
GCC
GAC
GGC
C
GUA
GCA
GAA
(Glu/E)
谷氨酸
GGA
A
GUG
GCG
GAG
GGG
G
A密码子AUG同时编码甲硫氨酸并作为起始点:在信使RNA的编码区里,首个ATG的出现标志着蛋白质翻译的开始。
[8]
B^^^标示终止密码子为琥珀、赭石和蛋白石的历史原因可在悉尼·布伦纳(SydneyBrenner)的自传[9]和鲍勃·埃德加(BobEdgar)的一篇历史性文章中找到。
[10]
反义RNA(anti-senseRNA)[编辑]
在许多真核生物中,当反义RNA上的碱基与基因的某段mRNA互补时,反义RNA可以抑制翻译。
反义RNA存在于细胞中之时,其互补的基因就不会合成蛋白质。
这也许是一种对抗逆转录转座子或病毒复制的一种机制(retrotransposons是以双股RNA作中介状态的转座子),因为这两者都能使用双链RNA当中介物。
在生物化学的研究中,借由使用一段反义mRNA使得标靶mRNA无法作用(RNA干扰),这种方法已经被广泛用于研究基因的功能;例如利用RNA干扰技术,秀丽隐杆线虫中所有基因的作用几乎已经被研究完了。
参考文献[编辑]
^IborraFJ,JacsonDA,CookPR.Coupledtranscriptionandtranslationwithinnucleiofmammaliancells.Science.2001,293(5532):1139–42.PMID11423616.
^2.02.1WilliamF.Marzluff,EricJ.Wagner&RobertJ.Duronio.MetabolismandregulationofcanonicalhistonemRNAs:lifewithoutapoly(A)tail.NatureReviewsGenetics.November2008,9(11):843–854.PMC 2715827 .PMID 18927579.doi:10.1038/nrg2438.
^Glanz,Stephanie;KĂźck,Ulrich.Trans-splicingoforganelleintrons-adetourtocontinuousRNAs.BioEssays(Wiley-Blackwell).2009,31(9):921–934[2017-02-28].doi:10.1002/bies.200900036.
^HiggsDR,GoodbournSE,LambJ,CleggJB,WeatherallDJ,ProudfootNJ.Alpha-thalassaemiacausedbyapolyadenylationsignalmutation.Nature.1983,306(5941):398–400.PMID6646217.
^Berg,Tymoczko&Stryer2007,第841页harvnberror:notarget:CITEREFBergTymoczkoStryer2008(help)
^Sachs,AlanB.MessengerRNAdegradationineukaryotes.Cell(ElsevierBV).1993,74(3):413–421[2017-02-28].doi:10.1016/0092-8674(93)80043-e.
^LuYF,MaugerDM,GoldsteinDB,UrbanTJ,WeeksKM,BradrickSS.IFNL3mRNAstructureisremodeledbyafunctionalnon-codingpolymorphismassociatedwithhepatitisCvirusclearance.ScientificReports.Nov2015,5:16037.PMID 26531896.doi:10.1038/srep16037.
^NakamotoT.Evolutionandtheuniversalityofthemechanismofinitiationofproteinsynthesis.Gene.March2009,432(1–2):1–6.PMID 19056476.doi:10.1016/j.gene.2008.11.001.
^BrennerS.ALifeinScience(2001)PublishedbyBiomedCentralLimitedISBN0-9540278-0-9seepages101-104
^ThegenomeofbacteriophageT4:anarcheologicaldig.Genetics.2004,168(2):575–82.PMC 1448817 .PMID 15514035.
参见[编辑]
RNA干扰(RNAi)
美国莫德纳生技公司
mRNA疫苗
查论编核酸种类组分
核碱基
核苷
核苷酸
寡核苷酸/多核苷酸(英语:polynucleotide)
脱氧核苷酸
核糖核酸(编码与非编码)转译:
mRNA
前-mRNA/不均一核RNA
tRNA
rRNA
tmRNA
调控:
RNA干扰
miRNA
siRNA
piRNA
asRNA
RNA加工
snRNA
snoRNA
YRNA
增强子RNA
其他:
gRNA
核酶
shRNA
stRNA(英语:SmalltemporalRNA)
ta-siRNA
脱氧核糖核酸cDNA ·cpDNA ·gDNA ·Hachimoji ·msDNA ·mtDNA ·脱氧核酶核酸类似物(英语:Nucleicacidanalogue)
异源核酸(英语:Xenonucleicacid)
GNA
TNA
己糖
LNA
PNA
吗啉基
载体
噬菌粒(英语:Phagemid)
质粒
λ噬菌体
黏质体
F黏粒
人工染色体
PAC
细菌
酵母菌
人类
查论编生物化学物质种类索引糖类
醇类
糖醇
糖蛋白
苷
酯质
类花生酸类
脂肪酸
中间物
甘油酯
磷脂
鞘脂类
胆固醇与甾体中间产物
核酸
成分
中间物
蛋白质
氨基酸
中间物
其他
四吡咯
中间物
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