信使核糖核酸- 维基百科,自由的百科全书
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信使核糖核酸(英語:messenger RNA,縮寫:mRNA),是由DNA經由轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。
在细胞中,mRNA從合成到被降解, ...
信使核糖核酸
核糖核酸
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信使核糖核酸(英語:messengerRNA,縮寫:mRNA),是由DNA經由轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。
在細胞中,mRNA從合成到被降解,經過了數個步驟。
在轉錄的過程中,第二型RNA聚合酶(RNApolymeraseII)從DNA中複製出一段遺傳訊息到前mRNA(尚未經過修飾或是部分經過修飾的mRNA,英文pre-messengerRNA,簡稱pre-mRNA,或是heterogeneousnuclearRNA,簡稱hnRNA)上。
在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA並未被進一步處理(但有些罕有的特例),而經常是邊轉錄邊轉譯。
在真核生物中,轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置,轉錄發生在儲存DNA的細胞核中,而轉譯是發生在細胞質中。
不過,曾有研究學者認為真核生物亦有邊轉錄邊轉譯的現象[1],只是這個觀點未被廣泛接受。
mRNA在真核細胞中的交互作用。
Pre-mRNA經由轉錄被創造出來;在經過增加5'端帽、剪接和加上多聚腺苷酸尾鏈之後成為mRNA,被運送到細胞質,然後由核糖體進行轉譯產生蛋白質。
目次
1轉錄後修飾
2非編碼區/未翻譯區
3mRNA密碼子與胺基酸的對應
4反義RNA(anti-senseRNA)
5參考文獻
6參見
轉錄後修飾編輯
主條目:轉錄後修飾
在真核生物中,mRNA在準備好轉譯前需要經過多個處理步驟:
首先pre-mRNA需要加上一個5'端帽(capping)--經過甲基化(methylation)修飾的鳥嘌呤被加到mRNA的3'端。
這個5'端帽對於mRNA運輸到細胞質並與之後接到適當的核糖體,以及mRNA本身的穩定是相當重要的。
mRNA如果缺乏5'端帽,則很容易就被降解掉。
而mRNA由5'到3'的降解亦是由移除5'端帽開始。
mRNA剪接(mRNAsplicing)--mRNA前體去除掉內含子而保留外顯子的修飾過程。
通常mRNA前體能經由數種不同的剪接方式,產生不同組態/型式的mRNA,使一段基因在不同的組織或發育過程中能經過轉錄-剪接-轉譯後產生不同型式的蛋白質,進而擁有不同的作用,或是產生出穩定性差的mRNA達到調控基因表現的目的。
這種剪接型態叫做選擇性剪接。
絕大部分mRNA的剪接都是由剪接體所執行,只有少數例外,例如histonemRNA沒有內含子,但是其pre-mRNA卻需要經由另外的剪接方式才能產生成熟mRNA[2]。
以上所述為分子內剪接(cis-splicing),而mRNA剪接作用亦可發生在不同mRNA分子之間(trans-splicing),後者常見於原生生物的mRNA剪接[3]。
除了mRNA之外,有些RNA分子也有能力催化自身的修剪,例如核酸酶會做自我切除,而第I或第II型外顯子在特殊環境下可以不藉由蛋白質酵素的作用而進行剪接,稱為自剪接作用。
多聚腺苷酸化(polyadenylation)--藉由酵素多聚腺苷酸聚合酶(poly(A)+polymerase),在mRNA前體的3'端上加上了一段數個腺嘌呤序列(通常是數百個),(這項修飾並不會出現在原核生物中)。
這段多聚腺苷酸尾鏈在轉錄的時候,會因為mRNA上一段特殊的訊息,AAUAAA,而在mRNA後方特定位置上加上多聚腺苷酸尾鏈。
多聚腺苷酸尾鏈會被多聚腺苷酸結合蛋白(poly(A)+tail-bindingprotein,PABP)辨識並保護住。
這段AAUAAA訊號的重要性可以從以下這個例子看出:當要轉錄時,DNA分子上的AATAAA片段如果產生突變,將會導致某些血紅素缺陷[4]。
另外,對於部分histonemRNA而言,此過程是不被需要的[2]。
改變tRNA對mRNA上密碼子的識別,更可能改變了蛋白質上胺基酸的組成。
多聚腺苷酸化(polyadenylation)能增加轉錄的半生期,使得mRNA在細胞中的存在時間能延長得久一些,因此能再轉譯出更多的蛋白質。
在pre-mRNA在被修飾過之後(包含RNA剪接及加上5'端帽與3'端上多聚腺苷酸尾),形成成熟的mRNA,從而可準備進行轉譯。
成熟mRNA從細胞核被送出到細胞質中,然後核糖體結合在其上,開始轉譯出蛋白質[5]。
隨著時間進行,mRNA的多聚腺苷酸尾會被專門的外切核酸酶縮短,而5'端帽也可能被除去,使得該聚合物易受到核酸外切酵素的影響而被降解[6]。
成熟真核細胞的mRNA的結構。
一個完整的mRNA包括有5'端帽、5'非轉譯區、編碼區、3'非轉譯區和poly(A)尾鏈。
非編碼區/未翻譯區編輯
在RNA起始密碼子之前,與終止密碼子(stopcodon)之後,各有一段非編碼區,各被稱作5'UTR與3'UTR,(5'與3'非編碼區,因為DNA與RNA分子都是由5'端到3'端,也就是說這些區域是在RNA分子的兩端)是屬於不轉譯出蛋白質的序列。
然而,這些區域的重要性在於它們的序列有可能藉由這些區域與不同的RNA結合蛋白(RNA-bindingprotein)結合,進而改變在細胞中的位置、決定mRNA的穩定性/半生期,以及對細胞受到刺激時的反應而生的轉譯調控。
這些都是與細胞調控本身的活性有關。
在UTRs上的某些蛋白質複合物不僅能影響RNA的穩定度,也能促進轉譯效率或是抑制轉譯,這多是依據位在UTRs上的序列而定。
有些在UTR上的基因遺傳的變異也會造成上述的RNA穩定度或是轉譯效率的改變。
[7]一些包含在UTRs的功能性序列,常能形成一些有特性的二級結構,這些造成二級結構也牽扯到調節mRNA本身。
某些序列,像是SECIS,是蛋白質結合區[來源請求]。
其中一類的mRNA元素,riboswitches,能直接結合上小分子,改變了mRNA自身的摺疊結構,也影響了轉錄或是轉譯作用[來源請求]。
另外,有些mRNA的3'UTR含有AU-richelemnet(ARE),能影響到mRNA的半生期[來源請求]。
換句話說,mRNA分子可以進行自我調控。
mRNA密碼子與胺基酸的對應編輯
胺基酸生化性質
非極性
極性
鹼性
酸性
終止密碼子
標準遺傳密碼
鹼基1
鹼基2
鹼基3
U
C
A
G
U
UUU
(Phe/F)苯丙胺酸
UCU
(Ser/S)絲胺酸
UAU
(Tyr/Y)酪胺酸
UGU
(Cys/C)半胱胺酸
U
UUC
UCC
UAC
UGC
C
UUA
(Leu/L)白胺酸
UCA
UAA[B]
終止(赭石)
UGA[B]
終止(蛋白石)
A
UUG
UCG
UAG[B]
終止(琥珀)
UGG
(Trp/W)色胺酸
G
C
CUU
CCU
(Pro/P)脯胺酸
CAU
(His/H)組胺酸
CGU
(Arg/R)精胺酸
U
CUC
CCC
CAC
CGC
C
CUA
CCA
CAA
(Gln/Q)麩胺醯胺
CGA
A
CUG
CCG
CAG
CGG
G
A
AUU
(Ile/I)異白胺酸
ACU
(Thr/T)蘇胺酸
AAU
(Asn/N)天門冬醯胺
AGU
(Ser/S)絲胺酸
U
AUC
ACC
AAC
AGC
C
AUA
ACA
AAA
(Lys/K)離胺酸
AGA
(Arg/R)精胺酸
A
AUG[A]
(Met/M)甲硫胺酸
ACG
AAG
AGG
G
G
GUU
(Val/V)纈胺酸
GCU
(Ala/A)丙胺酸
GAU
(Asp/D)天門冬胺酸
GGU
(Gly/G)甘胺酸
U
GUC
GCC
GAC
GGC
C
GUA
GCA
GAA
(Glu/E)麩胺酸
GGA
A
GUG
GCG
GAG
GGG
G
A密碼子AUG同時編碼甲硫胺酸並作為起始點:在信使RNA的編碼區里,首個ATG的出現標誌著蛋白質轉譯的開始。
[8]
B^^^標示終止密碼子為琥珀、赭石和蛋白石的歷史原因可在雪梨·布倫納(SydneyBrenner)的自傳[9]和鮑勃·埃德加(BobEdgar)的一篇歷史性文章中找到。
[10]反義RNA(anti-senseRNA)編輯
在許多真核生物中,當反義RNA上的鹼基與基因的某段mRNA互補時,反義RNA可以抑制轉譯。
反義RNA存在於細胞中之時,其互補的基因就不會合成蛋白質。
這也許是一種對抗反轉錄轉座子或病毒複制的一種機制(retrotransposons是以雙股RNA作中介狀態的轉座子),因為這兩者都能使用雙鏈RNA當中介物。
在生物化學的研究中,藉由使用一段反義mRNA使得標靶mRNA無法作用(RNA干擾),這種方法已經被廣泛用於研究基因的功能;例如利用RNA干擾技術,秀麗隱桿線蟲中所有基因的作用幾乎已經被研究完了。
參考文獻編輯
^IborraFJ,JacsonDA,CookPR.Coupledtranscriptionandtranslationwithinnucleiofmammaliancells.Science.2001,293(5532):1139–42.PMID11423616.
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^BrennerS.ALifeinScience(2001)PublishedbyBiomedCentralLimitedISBN0-9540278-0-9seepages101-104
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參見編輯
RNA干擾(RNAi)
美國莫德納生技公司
mRNA疫苗
取自「https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=信使核糖核酸&oldid=67213707」
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