台灣A2B血型之基因分型__臺灣博碩士論文知識加值系統
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ABO血型的對偶基因位於人類第9對染色體上9q34.1~q34.2位置,其中包含了7個外顯子(exon),18 kb的 ... 藉以觀察A2B亞血型在台灣的所有AB型當中是否佔有如此高的比例。
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ABO血型的對偶基因主要分為三種:A對偶基因、B對偶基因、O對偶基因。
ABO血型的對偶基因位於人類第9對染色體上9q34.1~q34.2位置,其中包含了7個外顯子(exon),18kb的基因組(genomicDNA)。
其中第7個外顯子長度最長,而在O對偶基因的第6個外顯子有一個核甘酸缺失因而造成酵素活性的消失。
A對偶基因與B對偶基因之間有7個核甘酸的差異,其中造成了四種胺基酸的不同,分別在第176位置精胺酸轉換成甘胺酸(Arg176Gly),第235位置甘胺酸轉換成絲胺酸(Gly235Ser),在第266位置白胺酸轉換成甲醯胺酸(Leu266Met),在第268位置甘胺酸轉換成丙氨酸(Gly268Ala)。
而O對偶基因與A對偶基因的區別在於O對偶基因在核甘酸第261位置缺少了一個鳥糞嘌呤(guanine)因而造成了核甘酸序列位移而缺乏酵素活性。
利用分子生物學方法來協助分析ABO亞血型的基因型,以解決一些利用血清學分析之ABO血型結果矛盾已經是廣泛被利用的。
我們與高雄捐血中心合作,由高雄捐血中心在2004年時收集到台灣中南部地區的A2B亞血型捐贈者共127位,其中的61位已經利用分子生物學方法檢測其基因型,藉以觀察A2B亞血型在台灣的所有AB型當中是否佔有如此高的比例。
所有A2B的表現型是利用血清學方法做檢測。
利用聚合酶連鎖反應-限制長度多型性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism)的方法,針對鹼基261以及鹼基703的位置,作ABO對偶基因的O基因,B基因做初步篩檢,基於血型O型在鹼基第261位置的鳥糞嘌呤(guanine)是缺損的,而在鹼基703的位置,A對偶基因與O對偶基因都是鳥糞嘌呤(guanine),B對偶基因則是腺嘌呤(adenine)的這些特性,先使用限制酶做初步篩檢。
接著做A2對偶基因的各種基因型檢測,包括A201,A202,A203,A204,A205,A206,A207,A208與A209的檢測,使用的方法也是聚合酶連鎖反應-限制長度多型性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism)。
進一步確認的方法則是利用基因選殖後做定序。
結果在61位捐贈者的檢體中有55位是屬於A205與Ballele這樣的對偶基因組合(佔了90%),兩位是A201與Ballele的對偶基因組合。
另外四位是具有cis-ABallele,其中兩位是cis-AB04與Oallele對偶基因組合,一位是cis-AB01與Oallele對偶基因組合,最後一位則是cis-AB02與Ballele對偶基因組合。
根據我們的研究結果顯示,在台灣血型表現型為A2B的人,他們的基因型大部分都屬於A205與Ballele的對偶基因組合,而A205,A201與cis-AB02alleles是首次在台灣報告。
TheABOlocushasthreemainallelicforms:Aallele,Ballele,andOallele.Itislocatedonchromosome9at9q34.1-q34.2andcontains7exonsthatspanmorethan18kbofgenomicDNA.Exon7isthelargestandcontainsmostofthecodingsequence.Exon6containsthedeletionthatisfoundinmostOallelesandresultsinalossofenzymaticactivity.TheAandBallelesdifferfromeachotherbysevennucleotidesubstitutions,whichresultinAandBtransferasesthatdifferbyfouraminoacids(Arg176Gly,Gly235Ser,Leu266Met,Gly268Ala).TheOallelediffersfromtheAallelebydeletionofguanineatposition261.Thedeletioncausesaframeshiftandresultsthelackingofenzymaticactivity.MoleculargenotypingoftheABOalleleshasbeenwidelyusedinABOsubgroupsanalysisandsolvedtherareABObloodgroupingdiscrepancies.Onehundredandtwenty-sevenA2Bdonorswerefoundfromthe8448ABblooddonorscollectedfromtwobloodcentersin2004inTaiwan.Sixty-oneA2BdonorswereanalyzedbymeansofmolecularmethodstoinvestigatetheallelesresultingintheA2BphenotypedistributioninTaiwan.TheA2Bphenotypewasidentifiedbyserologicaltest.Thepolymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphismmethodwasusedtoscreenABOallelesatnucleotide(nt)261and703basedonthentdifferencesoftheABOalleles.ThesubgroupsoftheA2alleleweredeterminedbythePCR-RFLPmethod.ThediscrepanciesbetweentheA2BphenotypeandgenotypeoftheA2Bwerethenstudiedbysubcloningandnucleotidesequenceanalyses.Fifty-fiveof61donors(90%)areA205andBallele;twoareA201andBallele.Fourcaseswereheterozygotesofcis-ABalleleandO/Balleles.Twowerecis-AB04andOallele,onewascis-AB01andOallele,andtheotherwascis-AB02andBallele.MostA2BgenotypesbelongtoA205andBalleleinTaiwan.TheA205,A201,andcis-AB02allelesarebeingreportedforthefirsttimeinTaiwan.
1.摘要---------------------------------------------------12.英文摘要-----------------------------------------------33.背景---------------------------------------------------54.研究材料與方法-----------------------------------------85.研究結果----------------------------------------------416.討論--------------------------------------------------437.參考文獻----------------------------------------------468.附表與附圖--------------------------------------------51
1.MckusickVA.KarlLandsteinerAward.FromKarlLandsteinertoPeterAgre:100yearsinthehistoryofbloodgroupgenetics.Transfusion2004;44:1370-1376.2.OlssonML,ChesterMA.PolymorphismandrecombinationeventsattheABOlocus:amajorchallengeforgenomicABObloodgroupingstrategies.TransfusMed2001;11:295-313.3.LeeJCI,ChangJG.ABOgenotypingbypolymerasechainreaction.JForensicSci1992;37:1269-1275.4.Hosseini-MaafB,HellbergA,RodriguesMJ,ChesterMA,OlssonML.ABOexonandintronanalysisinindividualswiththeAweakBphenotyperevealsanovelOlv-A2hybridallelethatcausesfourmissensemutationsintheAtransferase.BMCGenet.2003;4:17-28.5.YamamotoF,ClausenH,WhiteTetal.Moleculargeneticbasisofthehisto-bloodgroupABOsystem.Nature1990;345:229-233.6.YamamotoF,HakomoriS.Sugar-nucleotidedonorspecificityofhisto-bloodgroupAandBtransferasesisbasedonaminoacidsubstitutions.JBiolChem1990;265:19257-19262.7.OgasawaraK,YabeR,UchikawaM,SaitouN,BannaiM,NakataK,TakenakaM,FujisawaK,IshikawaY,JujiT,TokunagaK.MoleculargeneticanalysisofvariantphenotypeoftheABObloodgroupsystem.Blood1996;88:2732-2737.8.OlssonML,IrshaidNM,Hosseini-MaafB,HellbergA,MouldsMK,SarenevaH,ChesterMA.GenomicanalysisofclinicalsampleswithserologicABObloodgroupingdiscrepancies:identificationof15novelAandBsubgroupalleles.Blood2001;98:1585-1593.9.YamamotoF,McNeillPD,YamamotoM,HakomoriS,HarrisT,JuddWJ,DavenportRD.MoleculargeneticanalysisoftheABObloodgroupsystem:1.weaksubgroup:A3andB3alleles.VoxSang1993;64:116-119.10.ChesterMA,OlssonML.TheABObloodgroupgene:alocusofconsiderablegeneticdiversity.TansfusMedRev2001;15:177-200.11.YipSP.SequencevariationatthehumanABOlocus.AnnHumGenet2002;66:1-27.12.SunCF,YuLC,ChenDP,LinKT,WangWT,WangYC,YuLC.MoleculargeneticanalysisfortheAelandA3alleles.Transfusion2003;43:1138-44.13.Lin-ChuM,BroadberryRE,ChiouPW.TheB3phenotypeinChinese.Transfusion1986;26:428-430.14.YamamotoF,McNeillPD,HakomoriS.Humanhisto-bloodgroupA2transferasecodedbyA2allele,oneoftheAsubtypes,ischaracterizedbyasinglebasedeletioninthecodingsequence,whichresultsinanadditionaldomainatthecarboxylterminal.Biochem.Biophys.Res.Commun.1992;187:366-374.15.YipSP.Single-tubemultiplexPCR-SSCPanalysisdistinguishes7commonABOallelesandreadilyidentifiesnewalleles.Blood2000;95:1487-1492.16.ChenDP,TsengCP,WangWT,SunCF.IdentificationofanovelA2allelederivedfromtheAtransferasegenethroughanucleotidesubstitutionG539C.VoxSang.2005;88:196-199.17.ChenYJ,ChenPS,LiuHM,LyouJY,HuHY,LinJS,TzengCH.Novelpolymorphismsinexons6and7ofA/BAllelesdetectedbypolymerasechainreaction–singlestrandconformationpolymorphismVoxSang2006;90:119–127.18.YipSP,ChoiPS,LeeSY,LeungKH,El-ZawahriMM,LuqmaniYA.ABObloodgroupinKuwaitis:detailedallelefrequencydistributionandidentificationofnovelallelesTransfusion2006;46:773-779.19.OgasawaraK,YabeR,UchikawaM,BannaiM,NakataK,TakenakaM,TakahashiY,JujiT,TokunagaK.DifferentallelescauseanimbalanceinA2andA2BphenotypesoftheABObloodgroup.VoxSang1998;74:242-247.20.YamamotoF,McNeillPD,KominatoY,YamamotoM,HakomoriS,IshimotoS,NishidaS,ShimaM,FujimuraY.MoleculargeneticanalysisoftheABObloodgroupsystem:2.cis-ABalleles.VoxSang1993;64:120-123.21.MifsudNA,WattJM,CondonJA,HaddadaAP,SparrowRL.Anovelcis-ABvariantallelearisingfromanucleotidesubstitutionA796CintheBtransferasegene.Transfusion2000;40:1276-1277.22.RoubinetF,JanvierD,BlancherA.AnovelcisABallelederivedformaBallelethroughasinglepointmutation.Transfusion2002;42:239-246.23.TzengCH,ChenYU,LyouJY,ChenPS,LiuHM,HuHY,LinJS,YuLC.Anovelcis-ABallelederivedfromaunique796C>Amutationinexon7ofABOgene.Transfusion2005;45:50-55.24.ChangJG,ChenPH,ChiouSS,LeeLS,PerngLI,LiuTC.Rapiddiagnosisofβ-thalassemiamutationsinChinesebynaturallyandamplifiedcreatedrestrictionsites.Blood1992;80:2092–2096.25.YangMY,LiuTC,ChangJG,LinPM,LinSF.JunBgeneexpressionisinactivatedbymethylationinchronicmyeloidleukemia.Blood2003;101:3205-3211.26.MourantAE,KopecAC,Domaniewska-SobezakK.TheDistributionoftheHumanBloodGroupsandOtherPolymorphisms,ed2.London,OxfordUniversityPress,1976.27.YamaguchiH.ABOvariantsandatypicalantibodies.ProcJpnMedSoc1967;4:712-714.28.SeltsamA,HallenslebenM,KollmannA,BlasczykR.ThenatureofdiversityanddiversificationattheABOlocus.Blood2003;102:3035-3042.
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