一網打盡BRCA1所有核心突變!乳腺癌研究迎重大進
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今天,頂尖學術期刊《自然》上發表了一篇重磅論文。
一支來自華盛頓大學的科研團隊利用CRISPR技術,對乳腺癌重要風險基因BRCA1進行了「飽和式」的基因編輯,詳細解析了近4000個不同的單核苷酸變異會對這條基因產生怎樣的影響。
研究人員稱,這個發現有望立刻在臨床上得到應用。
相信很多學術經緯的讀者朋友們都知道BRCA1基因的名字。
它編碼的蛋白參與了DNA的修復過程,有重要的抑癌功能。
如果BRCA1基因出現了突變,就有可能影響到它的功能,從而增加癌症風險。
每年,美國都有數百萬女性接受BRCA1基因測序,了解自己的基因是否發生了突變。
但困擾著許多醫生的,正是「有可能」這三個字。
儘管BRCA1是人類研究最為深入的基因之一,但我們對它的功能,實際上還有很多不了解的地方。
我們知道其中的一些突變會顯著提高癌症風險,另一些突變則無傷大雅,不會對健康造成隱患。
但對於大多數BRCA1基因里出現的突變來說,我們卻說不出它究竟會造成怎樣的影響。
許多女性是因為有乳腺癌或卵巢癌的家族史,才決定接受BRCA1基因測序。
「我可能對一名女性進行了測序分析,發現她的BRCA1基因帶有一個突變,但我不知道這個突變是否會增加乳腺癌風險,還是完全沒有危害。
」本研究的通訊作者之一Jay
Shendure教授說道。
也就是說,這些女性朋友辛辛苦苦做了測序,得到的信息卻沒有實際應用價值,絲毫不能緩解她們的焦慮。
這一難題在本研究中得到了很好的解決。
科學家們設計了一個巧妙的實驗——他們找到了
一種特殊的細胞系HAP1。
在這種細胞系裡,一旦BRCA1蛋白失去其應有的功能,細胞就會死亡。
然後,他們應用了先進的基因編輯工具CRISPR-Cas9,對BRCA1基因的13個關鍵外顯子區域,進行了逐個核苷酸的突變工作。
可以想像,這是一個工作量巨大的項目。
為了加速研究的流程,研究人員們設計了一套新穎的系統。
他們每次在2000萬個細胞內,對一整段外顯子進行基因編輯。
隨後,研究人員們先讓這些細胞生長11天,再做後續的分析。
如果由於某個特定突變導致BRCA1失去其功能,相應的細胞就會死亡,後續分析中也就更難找到這種特定突變的存在。
利用這個方法,研究人員們在半年裡篩選了將近4000個位點,發現了400多種會讓BRCA1失去功能的突變,以及300多種會影響BRCA1表達的突變。
這涵蓋了BRCA1基因的主要功能區域。
目前,研究人員們已共享了這些信息。
未來的數年裡,他們還計劃將這項工作拓展到整條BRCA1基因上。
「我們希望這些數據能不斷增長。
當在女性中觀察到這些突變時,我們的數據能指導人們對測序結果的解讀。
」本研究的另一名通訊作者Lea Starita教授說道。
過去,我們也能對特定基因進行多個位點的篩選。
但能在短期內對如此多的位點進行「飽和式」的篩選,挨個評估單個鹼基對基因功能的影響,尚屬罕見。
這正是CRISPR-Cas9基因編輯工具與相應的分析技術結合之後,所迸發出的巨大潛力。
我們期待這項研究能儘快推廣到其他與疾病有關的基因上。
在這個精準醫學的時代,來自基因組的信息,能讓我們更好地理解疾病,並更快找到潛在的診斷與治療方案。
也許有朝一日,我們在癌症發病前數年,就能知道自己的命運。
這對於預防和治療而言,有著極大的應用價值。