北大謝曉亮等開發產前篩查新技術

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來自北京大學的研究人員報告稱,他們結合下一代測序及單細胞全基因組擴增技術,開發出了一種叫做非整倍體測序與連鎖分析(MARSALA)的方法來揭示突變等位基因,使得能夠以單分子精度進行胚胎診斷,大大降低了假陽性或假陰性錯誤。

這一重要的成果發布在12月28日的《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜誌上。

北京大學的謝曉亮(X. Sunney Xie) 教授、喬傑(Jie Qiao)教授及湯富酬(Fuchou Tang)研究員是這篇論文的共同通訊作者(延伸閱讀:謝曉亮院士Science子刊:開發先進腫瘤檢測技術 )。

體外受精(IVF)、胚胎植入前基因診斷(PGD)和胚胎植入前遺傳學篩查(PGS)可幫助患者選擇出沒有單基因疾病和非整倍性(染色體異常)的胚胎。

近年來下一代測序(NGS)的成本快速地下降,這一技術已大大提高了PGD/PGS的精度。

然而由於假陽性和假陰性單核苷酸變異(SNVs)限制了精度,目前PGD還未被接受用於IVF,只能藉助於連鎖分析如短串聯重複序列(short tandem repeats)或核型定位(karyomapping)。

值得注意的是,現有的SNV/拷貝數變異(CNV)檢測方法及連鎖分析往往需要對同一胚胎採用不同的程序。

在這篇PNAS新文章中研究人員報告稱開發出了一種基於NGS的PGD/PGS程序,可同時檢測單基因疾病和非整倍性,並能夠以一種經濟有效的方式進行連鎖分析。

這種稱作為MARSALA方法涉及用多次退火環狀循環技術(MALBAC)來實現單細胞全基因組擴增。

通過CNVs來決定非整倍體,採用PCR擴增MALBAC產物來檢測與單基因疾病相關的SNVs。

通過基於NGS的連鎖分析來避免假陽性和假陰性SNVs。

採用這樣的胚胎選擇,現已誕生了兩個沒有繼承父母單基因疾病的健康嬰兒。

這些單基因疾病分別源自攜帶疾病的父親與母親常染色體和X染色體上發生的單鹼基突變。

作者們說,這一MARSALA方法可以讓希望避免將他們的傳染病傳遞給後代的人夫婦受益。

(生物通:何嬙)


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