RNA複製酶- 维基百科,自由的百科全书

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RNA複製酶(RNA replicase)或名RNA依賴性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase),縮寫RdRp 或RDR,係一類能以RNA爲模板複製RNA的酶。

值得注意的是,這類酶與 ... RNA複製酶 語言 監視 編輯 提示:此條目的主題不是RNA聚合酶。

RNA複製酶(RNAreplicase)或名RNA依賴性RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerase),縮寫RdRp或RDR,係一類能以RNA爲模板複製RNA的酶。

值得注意的是,這類酶與以DNA爲模板合成RNA的RNA聚合酶(在轉錄中扮演重要角色的酶)不是同一類酶。

RNA複製酶RNA-dependentRNApolymerase RNA複製酶的結構PDB3PHU.[1] 命名 系統命名 縮寫 識別碼 EC編號 2.7.7.48 CAS號 9026-28-2 資料庫 IntEnz IntEnz瀏覽 BRENDA(英語:BRENDA) BRENDA入口 ExPASy(英語:ExPASy) NiceZyme瀏覽 KEGG KEGG入口 MetaCyc(英語:MetaCyc) 代謝路徑 PRIAM(英語:PRIAM_enzyme-specific_profiles) 概述 PDB RCSBPDBPDBjPDBePDBsum 基因本體 AmiGO/EGO 搜索 PMC 相關文獻 PubMed 相關文獻 RNAdependentRNApolymerase鑑定標誌RdRP_1PfamPF00680Pfam宗系CL0027InterPro(英語:InterPro)IPR001205 SCOP(英語:StructuralClassificationofProteins)2jlg/SUPFAM現有可用的蛋白結構:Pfam  結構/ECOD  PDBRCSBPDB;PDBe;PDBjPDBsum(英語:PDBsum)結構概要RNA-directedRNApolymerase,flaviviral鑑定標誌RNA_pol_flaviviralPfamPF00972InterPro(英語:InterPro)IPR000208現有可用的蛋白結構:Pfam  結構/ECOD  PDBRCSBPDB;PDBe;PDBjPDBsum(英語:PDBsum)結構概要HCVNS5BRdRPstalled4WTG RNA複製酶對於那些反義RNA病毒(例如流感病毒)的增殖來說,是一種至關重要的蛋白質[2][3]。

RNA複製酶能合成一條RNA單鏈的互補鏈[4][5]。

目次 1歷史 2分布 3結構 4參考 5外部連結 歷史編輯 病毒RdRps是在1960年代早期通過對腦膜炎病毒和脊髓灰質炎病毒的研究發現的,當時觀察到這些病毒對放線菌素不敏感,放線菌素是一種抑制細胞DNA指導的RNA合成的藥物。

這種缺乏敏感性表明有一種病毒特異性酶可以從RNA模板而不是從DNA模板複製RNA。

分布編輯 RdRps在整個病毒中高度保守,甚至與端粒酶有關,儘管截至2009年這是一個持續存在的問題[6]。

這種相似性導致推測病毒RdRps是人類端粒酶的祖先。

RdRp最著名的例子是脊髓灰質炎病毒。

結構編輯 所有的RNA複製酶和不少RNA聚合酶都有一個摺疊結構。

這個摺疊結構與三個亞結構域相連。

上面三個結構域的形狀和人的右手想像,因而分別被稱爲「四指」(fingers)、「手掌」(palm)、「拇指」(thumb)[7]。

其中,只有手掌亞結構域有一個由四條反向平行的多肽鏈構成的β-折疊結構和兩個α-螺旋結構,在各類RNA複製酶中高度保守。

其中,手掌亞結構域有三個高度保守的基元(A、B,以及C)。

基元A(D-x(4,5)-D)和基元C(GDD)在空間上並列。

這兩個基元中的天冬氨酸殘基與鎂離子和錳離子相連。

而B基元中的天冬醯胺殘基則與在脫氧三磷酸核苷中選三磷酸核糖核苷的過程有關,上述過程可以確保合成的是RNA而不是DNA[8]。

RNA複製酶的結構域的組織形式保守[9],其催化中心也是一樣。

RNA複製酶的催化中心是由一系列包含保守的胺基酸殘基的基元組成的,即使在同源性不高的編碼序列下也保守。

參考編輯 ^Akutsu,M;Ye,Y;Virdee,S;Chin,JW;Komander,D.MolecularbasisforubiquitinandISG15cross-reactivityinviralovariantumordomains.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.February2011,108(6):2228–33.PMC 3038727  .PMID 21266548.doi:10.1073/pnas.1015287108.  ^KooninEV,GorbalenyaAE,ChumakovKM.TentativeidentificationofRNA-dependentRNApolymerasesofdsRNAvirusesandtheirrelationshiptopositivestrandRNAviralpolymerases.FEBSLett.July1989,252(1–2):42–6.PMID 2759231.doi:10.1016/0014-5793(89)80886-5.  ^ZanottoPM,GibbsMJ,GouldEA,HolmesEC.AreevaluationofthehighertaxonomyofvirusesbasedonRNApolymerases.J.Virol.September1996,70(9):6083–96.PMC 190630  .PMID 8709232.  ^Jin,Z;Leveque,V;Ma,H;Johnson,K.A.;Klumpp,K.Assembly,purification,andpre-steady-statekineticanalysisofactiveRNA-dependentRNApolymeraseelongationcomplex.JournalofBiologicalChemistry.2012,287(13):10674–83.PMC 3323022  .PMID 22303022.doi:10.1074/jbc.M111.325530.  ^KaoCC,SinghP,EckerDJ.DenovoinitiationofviralRNA-dependentRNAsynthesis.Virology.September2001,287(2):251–60.PMID 11531403.doi:10.1006/viro.2001.1039.  ^SuttleCA.Virusesinthesea.Nature.September2005,437(7057):356–61.Bibcode:2005Natur.437..356S.PMID 16163346.S2CID 4370363.doi:10.1038/nature04160.  ^HansenJL,LongAM,SchultzSC.StructureoftheRNA-dependentRNApolymeraseofpoliovirus.Structure.August1997,5(8):1109–22.PMID 9309225.doi:10.1016/S0969-2126(97)00261-X.  ^GoharaDW,CrottyS,ArnoldJJ,YoderJD,AndinoR,CameronCE.PoliovirusRNA-dependentRNApolymerase(3Dpol):structural,biochemical,andbiologicalanalysisofconservedstructuralmotifsAandB.J.Biol.Chem.August2000,275(33):25523–32.PMID 10827187.doi:10.1074/jbc.M002671200.  ^O'ReillyEK,KaoCC.AnalysisofRNA-dependentRNApolymerasestructureandfunctionasguidedbyknownpolymerasestructuresandcomputerpredictionsofsecondarystructure.Virology.December1998,252(2):287–303.PMID 9878607.doi:10.1006/viro.1998.9463.  外部連結編輯  生物學主題 醫學主題詞表(MeSH):RNA+Replicase EC2.7.7.48 取自「https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=RNA複製酶&oldid=71670986」



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