張皓巽- 專任教師 - 國立臺灣大學植物病理與微生物學系

張皓巽助理教授植物病理與數據分析研究室. 專長. 豆科作物病害. 實驗室/辦公室. 學新館812室. 電話. 02-3366-9016. E-mail. [email protected]. Website. Togglenavigation NTU PPM Togglenavigation 中文 中文 English 系所介紹 本系沿革 系館設施 聯絡我們 規章與常用表單 本系成員 專任教師 兼任教師 名譽教授 研究生 研究人員 系辦人員 規章與常用表單 研究生專區 研究領域 提供學位&學位要求 入學管道 規章與常用表單 課程資訊 獎學金資訊 校友資訊 外籍生 實用連結 大學生專區 輔系&雙主修資訊 課程資訊 入學管道 實習機會 獎學金資訊 規章與常用表單 學生活動 外籍生 研究方向和團隊 細菌學研究群 真菌學研究群 病毒學研究群 線蟲學研究 環境病害學研究 應用微生物學研究 生物技術 微生物群相學研究群 消息公告 最新消息 學術活動 獎學金公告 學生活動訊息 徵才招生 服務 系友專區 系友會簡介 捐款說明 活動訊息 校友資訊 植微名人錄 規章與常用表單 資源連結 本系成員 專任教師 兼任教師 名譽教授 研究生 研究人員 系辦人員 規章與常用表單 首頁 本系成員 專任教師 張皓巽 張皓巽助理教授 植物病理與數據分析研究室 專長 豆科作物病害 實驗室/辦公室 學新館812室 電話 02-3366-9016 E-mail [email protected] Website https://scholar.google.com/citations?user=rCurbu0AAAAJ&hl=en&oi=ao 研究主題 實驗室成員 個人學經歷 教授課程 期刊論文 研討會論文 專書及專書論文 ◆植物抗病之全基因體關聯定位 ◆植物病原真菌之生物學與致病機制 ◆分子植物與微生物之交互作用 ◆基因體學與比較基因體學 ◆微生物群、擴增子定序與總體基因體學 ◆次世代定序、程式語言與數據分析 林鈺晟研究助理 吳秉祜博士生 楊舒凱(植醫學程)碩士生 黃承濬(植醫學程)碩士生 陳政諺碩士生 潘冠妤碩士生 ◆經歷 2022年5月–至今FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology/FrontiersinFungalBiology期刊審閱編輯(領域：真菌病原性) 2021年9月–至今PLOSONE期刊學術編輯(領域：植物科學；微生物學；遺傳學) 2021年9月–至今FrontiersinPlantScience期刊審閱編輯(領域：植物育種；植物病原交互作用) 2019年8月–至今國立臺灣大學植物病理與微生物學系助理教授 2017年1月–2019年6月美國密西根州立大學植物土壤與微生物學系博士後研究員 2016年6月–2017年1月美國伊利諾大學香檳分校作物科學系博士後研究員 ◆學歷 2014年8月–2016年5月美國伊利諾大學香檳分校作物科學系博士 2012年8月–2014年8月美國伊利諾大學香檳分校作物科學系碩士 2011年9月–2012年8月陸軍義務役 2007年9月–2011年6月國立臺灣大學植物病理與微生物學系學士 ◆植物病理學(合授) ◆植物病理學實驗(合授) ◆植物病理與微生物學導論(合授) ◆植物病理之多方生物交互作用 ◆植物病理與微生物學專論 ◆專題研究 Year Article 2022 Macrophominaphaseolinacausingcharcoalrotonsoybean(Glycinemax)inTaiwan AustralasianPlantDiseaseNotes vol.17,page.11 Ping-TseShih,Tsai-DeChang,Hsien-HaoLiu,Hao-XunChang,Ying-HongLin 2022 SuperoxideinitiatesthehyphaldifferentiationtomicrosclerotiaformationofMacrophominaphaseolina MicrobiologySpectrum vol.10,page.e02084-21 Hsien-HaoLiu,Cheng-ChunHuang,Ying-HongLin,Min-NanTseng,Hao-XunChang 2022 Genome-widetranscriptionalresponseofthecausalsoybeansuddendeathsyndromepathogenFusariumvirguliformetoasuccinatedehydrogenaseinhibitorfluopyram PestManagementScience vol.78,page.530-540 HyunkyuSang,Hao-XunChang,SungyuChoi,DoeunSon,GaheeLee,andMartinI.Chilvers 2022 FirstreportofsoybeanseedlingdiseasecausedbyRhizoctoniasolaniAG-7inTaiwan PlantDisease vol.106,page.314 Yu-ChengLin,Min-NanTseng,andHao-XunChang 2021 Copynumberquantificationforthesoybeancystnematoderesistancelocusrhg1inthesoybeanvarietiesofTaiwan Agronomy vol.11,page.1346 Cheng-ChunHuang,Jiue-inYang,Kuo-LungChou,Chen-HsiangLin,andHao-XunChang 2021 FirstreportofCorynesporacassiicolacausingtargetspotonsoybeaninTaiwan PlantDisease vol.105,page.3753 PoKuanLu,Hsien-HaoLiu,andHao-XunChang 2021 Aβ‐lactamasegeneofFusariumoxysporumaltersrhizospheremicrobiotaofsoybean ThePlantJournal vol.106,page.1588-1604 Hao‐XunChang,ZacharyA.Noel,andMartinI.Chilvers 2021 FirstreportofleafspotcausedbyDiaporthetulliensisonBostonIvy(Parthenocissustricuspidata)inTaiwan PlantDisease vol.105,page.2718 Cheng-ChunHuang,Hsien-HaoLiu,Ping-HuWu,andHao-XunChang 2021 WholegenomesequenceresourceofCalonectriailicicola,thecasualpathogenofsoybeanredcrownrot MolecularPlant-MicrobeInteractions vol.34,page.848-851 Hsien-HaoLiu,JieWang,Ping-HuWu,Mei-YehJadeLu,Jeng-YiLi,Yuan-MinShen,Min-NanTzeng,Chang-HsinKuo,Ying-HongLin,andHao-XunChang 2021 Phylogenomicanalysisofa55.1kb19-genedatasetresolvesamonophyleticFusariumthatincludestheFusariumsolaniSpeciesComplex Phytopathology vol.111,page.1064-1079 DavidMGeiser,AbdullahAl-Hatmi,TakayukiAoki,TsutomuArie,VirgilioBalmas,IreneBarnes,GaryCBergstrom,M.K.K.Bhattacharyya,CherylL.Blomquist,RobertBowden,BalázsBrankovics,DarenW.Brown,LesterWilliamBurgess,KathrynBushley,MarkBusman,JoséF.Cano-Lira,JosephD.Carrillo,Hao-XunChang,Chi-YuChen,WanquanChen,MartinI.Chilvers,SofiaNoemiChulze,JeffreyJ.Coleman,ChristinaA.etal 2020 Linkagemappingforfoliarnecrosisofsoybeansuddendeathsyndrome Phytopathology vol.110,page.907-915 Hao-XunChang,ZixiangWen,RuijuanTan,HongxuDong,DanielP.Wickland,DechunWang,MartinI.Chilvers 2020 VariationinsoybeanrhizosphereoomycetecommunitiesfromMichiganfieldswithcontrastingdiseasepressures AppliedSoilEcology vol.150,page.103435 ZacharyA.Noel,Hao-XunChang,MartinI.Chilvers 2020 FirstreportofredcrownrotcausedbyCalonectriailicicolaonsoybeaninTaiwan PlantDisease vol.104,page.979 Hsien-HaoLiu,Yuan-MinShen,Hao-XunChang,Min-NanTseng,Ying-HongLin 2019 CharacterizationofsoybeanSTAY-GREENgenesinsusceptibilitytofoliarchlorosisofsuddendeathsyndrome PlantPhysiology vol.180,page.711-717 Hao-XunChang,RuijuanTan,GlenL.Hartman,ZixiangWen,HyunkyuSang,LeslieL.Domier,StevenA.Whitham,DechunWang,MartinI.Chilvers 2019 ASclerotiniasclerotiorumtranscriptionfactorinvolvedinsclerotialdevelopmentandvirulenceonpea mSphere vol.4,page.e00615-18 HyunkyuSang,Hao-XunChang,MartinI.Chilvers 2019 Genome-wideassociationandgenomicpredictionidentifiessoybeancystnematoderesistanceincommonbeanincludingasyntenicregiontosoybeanRhg1locus HorticultureResearch vol.6,page.9 LiweiWen,Hao-XunChang,PatrickJ.Brown,LeslieL.Domier,GlenL.Hartman 2018 FluopyramsensitivityandfunctionalcharacterizationofSdhBintheFusariumsolanispeciescomplexcausingsoybeansuddendeathsyndrome FrontiersinMicrobiology vol.9,page.2335 HyunkyuSang,AlexanderWitte,JanetteL.Jacobs,Hao-XunChang,JieWang,MitchellG.Roth,MartinI.Chilvers 2018 Annotationresourceoftandemrepeat-containingsecretoryproteinsinsixtyfungi FungalGeneticsandBiology vol.119,page.7-19 Hao-XunChang,ZacharyA.Noel,HyunkyuSang,MartinI.Chilvers 2018 Exploringthegeneticsoflesionandnodalresistanceinpea(PisumsativumL.)toSclerotiniasclerotiorumusinggenome‐wideassociationstudiesandRNA‐Seq PlantDirect vol.2,page.e00064 Hao‐XunChang,HyunkyuSang,JieWang,KevinE.McPhee,XiaofengZhuang,LyndonD.Porter,MartinI.Chilvers 2018 LeafandcanopyleveldetectionofFusariumvirguliforme(suddendeathsyndrome)insoybean RemoteSensing vol.10,page.3 IttaiHerrmann,StevenK.Vosberg,PrabuRavindran,AdityaSingh,Hao-XunChang,MartinI.Chilvers,ShawnP.Conley,PhilipA.Townsend 2018 Integrationofsuddendeathsyndromeresistancelociinthesoybeangenome TheoreticalandAppliedGenetics vol.131,page.757-773 Hao-XunChang,MitchellG.Roth,DechunWang,SilviaR.Cianzio,DavidA.Lightfoot,GlenL.Hartman,MartinI.Chilvers 2017 CharacterizationofinsectresistancelociintheUSDAsoybeangermplasmcollectionusinggenome-wideassociationstudies FrontiersinPlantScience vol.8,page.670 Hao-XunChang,GlenLHartman 2017 Metagenome-wideassociationstudyandmachinelearningpredictionofbulksoilmicrobiomeandcropproductivity FrontiersinMicrobiology vol.8,page.519 Hao-XunChang,JamesS.Haudenshield,CharlesR.Bowen,GlenL.Hartman 2016 CharacterizationofdiseaseresistancelociintheUSDAsoybeangermplasmcollectionusinggenome-wideassociationstudies Phytopathology vol.106,page.1139-1151 Hao-XunChang,AlexanderE.Lipka,LeslieL.Domier,GlenL.Hartman 2016 GenomiccharacterizationofplantcellwalldegradingenzymesandinsilicoanalysisofxylansesandpolygalacturonasesofFusariumvirguliforme BMCMicrobiology vol.16,page.147 Hao-XunChang,CraigRYendrek,GustavoCaetano-Anolles,GlenLHartman 2016 Genome-wideassociationandgenomicpredictionidentifiesassociatedlociandpredictsthesensitivityofTobaccoringspotvirusinsoybeanplantintroductions BMCGenomics vol.17,page.153 Hao-XunChang,PatrickJBrown,AlexanderELipka,LeslieLDomier,GlenLHartman 2016 IdentificationofmultiplephytotoxinsproducedbyFusariumvirguliformeincludingaphytotoxiceffector(FvNIS1)associatedwithsuddendeathsyndromefoliarsymptoms MolecularPlant-MicrobeInteractions vol.29,page.96-108 Hao-XunChang,LeslieL.Domier,OsmanRadwan,CraigR.Yendrek,MatthewE.Hudson,GlenL.Hartman 2015 Researchadvancesandmanagementofsoybeansuddendeathsyndrome Cropprotection vol.73,page.60-66 GlenL.Hartman,Hao-XunChang,LeonorF.Leandro 2014 Melanin-independentaccumulationofturgorpressureinappressoriaofPhakopsorapachyrhizi Phytopathology vol.104,page.977-984 Hao-XunChang,LouAnnMiller,GlenLHartman Year Article 2021 PotentialadaptivegeneticvariationinMacrophominaphaseolinaasrevealedbyenvironmentalassociationonthewhole-genomedata Phytopathology[AbstractCollection] vol.111,page.S2.4. OrtizV.Londono,Hao-XunChang,HyunkyuSang,KierstenA.Wise,andMartinI.Chilvers. 2021 AssessmentsoffungicidesensitivityandsoybeanresistancetoredcrownrotfungusCalonectriailicicola JournalofPlantMedicine[AbstractCollection] vol.63,page.61 Ping-HuWu,Min-NanTzeng,andHao-XunChang 2021 IntegrationofRNA-SeqandreactiveoxygenspeciesinhibitionassaytostudymicrosclerotiadevelopmentofMacrophominaphaseolina JournalofPlantMedicine[AbstractCollection] vol.63,page.57 Hsien-HaoLiu,Min-NanTzeng,andHao-XunChang 2021 SuddenDeathSyndromeofSoybean JournalofPlantMedicine[AbstractCollection] vol.63,page.39 Hao-XunChang 2020 Thediseasesofadzukibeanseedlingstemandroot JournalofPlantMedicine[AbstractCollection] vol.62,page.72 Hsien-HaoLiu,Hao-XunChang,andMin-NanTzeng 2018 Characterizationofasuddendeathsyndrome(SDS)coreeffectorusingcomparativegenomicsbetweenSDS-causingandnon-SDS-causingFusariumspecies Phytopathology[AbstractCollection] vol.108,page.110 Hao-XunChang,HyunkyuSang,LeslieL.Domier,MartinI.Chilvers 2018 TemperatureadaptationandfungicidesensitivityinMacrophominaphaseolina,thecausalagentofcharcoalrotonsoybeananddrybean Phytopathology[AbstractCollection] vol.108,page.125 VivianaOrtizLondono,HyunkyuSang,Hao-XunChang,ZacharyNoel,KierstenWise,MartinI.Chilvers 2018 CharacterizationofanoveltranscriptionfactorfromSclerotiniasclerotioruminducedduringinfectionofpea Phytopathology[AbstractCollection] vol.108,page.42 HyunkyuSang,Hao-XunChang,MartinI.Chilvers 2017 Meta-analysisforquantitativeresponsesofsoybeansuddendeathsyndrome Phytopathology[AbstractCollection] vol.107,page.(Suppl.5):S5.168 Hao-XunChang,MitchellRoth,DechunWang,GlenL.Hartman,MartinI.Chilvers 2016 XVIICongressonMolecularPlant-MicrobeInteractionsMeetingReport MolecularPlant-MicrobeInteractions vol.29,page.S6,S21 IS-MPMITravelAwardees,Hao-XunChang 2015 Identificationofatoxicprotein,FvTox6,producedbyFusariumvirguliformethatcausesfoliarsymptomstypicalofsoybeansuddendeathsyndrome Phytopathology[AbstractCollection] vol.105,page.(Suppl.4)S4.27 Hao-XunChang,LeslieL.Domier,OsmanRadwan,CraigR.Yendrek,MathewE.Hudson,GlenL.Hartman 2014 SecretoryplantcellwalldegradingenzymeexpressionanalysisandpolygalacturonasemodelingofFusariumvirguliforme Phytopathology[AbstractCollection] vol.104,page.(Suppl.3):S3.24 Hao-XunChang,CraigR.Yendrek,GlenL.Hartman Year Article 2016 IdentificationofphytotoxinsproducedbyFusariumvirguliformeassociatedwithfoliarsymptomsofsuddendeathsyndromeandgenome-wideassociationstudiesforsoybeandiseaseresistance Ph.D.DissertationUniversityofIllinoisatUrbana-Champaign Hao-XunChang 2016 Successfultechnologiesandapproachesusedtodevelopandmanageresistanceagainstcropdiseasesandpests EmergingtechnologiesforpromotingfoodSecurity.WoodheadPublishing. page.43-66 GlenL.Hartman,MichelleL.Pawlowski,Hao-XunChang,CurtisB.Hill 研究室簡介 大豆抗病遺傳研究 台灣大豆與毛豆之抗病篩選與定位  大豆(Glycinemax(L.)Merr.)是臺灣重要作物之一，其使用途徑可二分為飼料油用的穀粒大豆或俗稱黃豆(grainsoybean)，以及作為蔬菜食用的毛豆或俗稱枝豆(vegetablesoybean,oredamame)。

其中毛豆的外銷價值於近年來穩定突破二十億臺幣，故又被稱作「臺灣綠金」。

黃豆與毛豆雖有不同的農藝育種偏好，但抗病蟲害之特性是黃豆和毛豆共同的目標。

其中種子與幼苗期的根腐病是兩者皆常遇到的病害，嚴重時可造成種子腐爛或幼苗萎凋。

根腐病的防治仰賴農藥於種子披衣(seedcoating)，但由於根腐病可由五種病原菌造成(Fusariumrootrot,Macrophominarootrot,Phytophthorarootrot,Pythiumrootrot,Rhizoctoniarootrot)，且已有不同病原菌之抗藥性形成，因此除了種子披衣之外，篩選抗病品系以及研究抗病基因為另一重要之病害防治方法。

我們實驗室研究台灣毛豆各式病害，方向包括分離重要之病原菌、篩選抗病性、以及利用genotyping-by-sequencing、QTLmapping、genome-wideassociationstudy等基因定位與統計方法，尋找與抗病關聯之分子標記與基因，期望提供台灣毛豆對於病害防治的學理與應用基礎。

​植物病原真菌的菌核生物學 炭腐病菌之微菌核形成機制研究 菌核菌(Sclerotiniasclerotiorum)、炭腐病菌(Macrophominaphaseolina)、立枯絲核菌(Rhizoctoniasolani)等植物病原真菌可以形成菌核或微菌核等特化構造，在田間殘存並成為未來的感染源。

因此研究菌核的形成機制，達到降低菌核於田間殘存的目標，是我們實驗室的研究興趣，並期望能針對形成菌核的病原真菌，開發整合性病害防治策略。

碩士班劉軒豪同學以炭腐病菌的微菌核為研究材料，建立了四個菌核形成階段的組織萃取方式，並利用高通量定序及轉錄體方式，發現炭腐病菌的微菌核形成與活性氧(Reactiveoxygenspecies,ROS)相關基因表現有顯著相關。

後續在抗氧化劑與氧化刺激物的外源添加培養實驗中，深入發現O2-扮演了刺激菌絲分化成微菌核的重要關鍵角色。

相關研究成果已發表在美國微生物學會的MicrobiologySpectrum期刊。

  實驗室成員參與大豆田間病害採集與聚餐 畢業學生： 劉軒豪(2021)碩士論文：整合轉錄體學與活性氧抑制實驗以探討炭腐病菌微菌核之形成。

林鈺晟(2022)碩士