【小鼠大学问】基因工程小鼠的命名规则|南模生物

野生型对照Gene+/+ 或WT (wildtype). 基因敲入. 将敲入的元件写在上标里，例如：. Shh 基因E177A 点突变 ... CN EN 个人中心| 退出 登录 注册 购物车0 模型资源 优吉鼠模型资源库 工具鼠 FindCre工具鼠 报告基因工具鼠 小鼠疾病模型 自发肿瘤小鼠模型 罕见病小鼠模型 传染病研究模型 神经系统疾病模型 代谢心血管疾病模型 自身免疫疾病模型 免疫学研究模型 免疫缺陷小鼠 免疫靶点人源化小鼠 细胞因子示踪小鼠 免疫细胞剔除小鼠 免疫细胞标记小鼠 基因修饰大鼠模型 基因人源化大鼠 免疫缺陷大鼠 大鼠疾病模型 荧光示踪大鼠 工具大鼠 模型定制 基因编辑技术 ES细胞打靶 CRISPR基因编辑 转基因 基因修饰类型 基因敲除 常规基因敲除 条件性基因敲除 基因敲入 常规基因敲入 点突变 条件性点突变 人源化 基因过表达 手术及药物疾病模型 肿瘤模型 CDX模型 PDX模型 HSC免疫系统人源化模型 PBMC免疫系统人源化模型 自身免疫疾病模型 银屑病小鼠模型 EAE小鼠模型 代谢模型 高脂饲料诱导糖尿病模型 消化系统模型 肠炎模型 肝纤维化模型 肝再生小鼠模型 胃部分切除模型 神经系统模型 帕金森小鼠模型 腰腿痛小鼠模型 细胞系 荧光细胞系 原代细胞系 人源化细胞系 野生型细胞系 野生型品系 野生型品系 周边配套服务 模型繁育 自然繁育 快速繁育 生物净化 保种服务 冻存与复苏 饲养管理 大小鼠饲养管理 鉴定服务 大小鼠鉴定服务 显微注射 受精卵/囊胚注射 药效及表型服务 药效评价模型 肿瘤模型 免疫靶点人源化小鼠 PBMC免疫系统人源化小鼠 HSC免疫系统人源化小鼠 CDX模型 PDX模型 基因人源化细胞系模型 自身免疫疾病模型 银屑病小鼠模型 EAE小鼠模型 表型分析 大小鼠 血液分析 影像学分析 病理学分析 基因与蛋白表达分析 行为学分析 代谢分析 斑马鱼 基因编辑与功能研究 药效学快速评价及筛选 药物安全性评估 线虫 基因编辑线虫 衰老与寿命研究 氧化应激研究 药效学快速评价及筛选 水土环境评价 资源与支持 资源 产品手册 历年文献 文献解读 知识干货 公开课 动物健康报告 数据库链接 支持 FAQ 技术支持 运输问题 投资者关系 关于我们 公司资质 发展历程 新闻动态 市场活动 小鼠 Togglenavigation 注册 登录 小鼠 模型资源 模型资源 优吉鼠模型资源库 优吉鼠模型资源库 工具鼠 工具鼠 FindCre工具鼠 报告基因工具鼠 小鼠疾病模型 小鼠疾病模型 自发肿瘤小鼠模型 罕见病小鼠模型 传染病研究模型 神经系统疾病模型 代谢心血管疾病模型 自身免疫疾病模型 免疫学研究模型 免疫学研究模型 免疫缺陷小鼠 免疫靶点人源化小鼠 细胞因子示踪小鼠 免疫细胞剔除小鼠 免疫细胞标记小鼠 基因修饰大鼠模型 基因修饰大鼠模型 基因人源化大鼠 免疫缺陷大鼠 大鼠疾病模型 荧光示踪大鼠 工具大鼠 模型定制 模型定制 基因编辑技术 基因编辑技术 ES细胞打靶 CRISPR基因编辑 转基因 基因修饰类型 基因修饰类型 基因敲除 常规基因敲除 条件性基因敲除 基因敲入 常规基因敲入 点突变 条件性点突变 人源化 基因过表达 手术及药物疾病模型 手术及药物疾病模型 肿瘤模型 肿瘤模型 CDX模型 PDX模型 HSC免疫系统人源化模型 PBMC免疫系统人源化模型 自身免疫疾病模型 自身免疫疾病模型 银屑病小鼠模型 EAE小鼠模型 代谢模型 代谢模型 高脂饲料诱导糖尿病模型 消化系统模型 消化系统模型 肠炎模型 肝纤维化模型 肝再生小鼠模型 胃部分切除模型 神经系统模型 神经系统模型 帕金森小鼠模型 腰腿痛小鼠模型 细胞系 细胞系 荧光细胞系 原代细胞系 人源化细胞系 野生型细胞系 野生型品系 野生型品系 野生型品系 周边配套服务 周边配套服务 模型繁育 模型繁育 自然繁育 快速繁育 生物净化 保种服务 保种服务 冻存与复苏 饲养管理 饲养管理 大小鼠饲养管理 鉴定服务 鉴定服务 大小鼠鉴定服务 显微注射 显微注射 受精卵/囊胚注射 药效及表型服务 药效及表型服务 药效评价模型 药效评价模型 肿瘤模型 肿瘤模型 免疫靶点人源化小鼠 PBMC免疫系统人源化小鼠 HSC免疫系统人源化小鼠 CDX模型 PDX模型 基因人源化细胞系模型 自身免疫疾病模型 自身免疫疾病模型 银屑病小鼠模型 EAE小鼠模型 表型分析 表型分析 大小鼠 大小鼠 血液分析 影像学分析 病理学分析 基因与蛋白表达分析 行为学分析 代谢分析 斑马鱼 斑马鱼 基因编辑与功能研究 药效学快速评价及筛选 药物安全性评估 线虫 线虫 基因编辑线虫 衰老与寿命研究 氧化应激研究 药效学快速评价及筛选 水土环境评价 资源与支持 资源与支持 资源 资源 产品手册 历年文献 文献解读 知识干货 公开课 动物健康报告 数据库链接 支持 支持 FAQ 技术支持 运输问题 投资者关系 关于我们 关于我们 公司资质 发展历程 新闻动态 市场活动 小鼠 0 首页 资源与支持 支持 【小鼠大学问】基因工程小鼠的命名规则 资源与支持 订阅电子通讯 与最新模式生物资讯保持同步 邮箱* 姓名* 单位* 立即订阅 感谢您的订阅！您将会收到一封激活邮件，以确认您的订阅。

讲座交流 点击申请 【小鼠大学问】基因工程小鼠的命名规则 2018-07-1011:15by南模生物 导出PDF 基因工程小鼠的命名规则 有没有发现，当你在查询或看paper时，往往会蹦出几个贼长的，还夹杂着数字、上标、符号的名称，比如：129-Trp53tm1Holl/J、FVB-Tg(PomcCre)5Brn......看上去很复杂的样子。

这些其实是基因工程小鼠的全名。

如果把这一长串字符解构一下，常见的基因工程小鼠可以分为两种命名方式： 基因定点修饰的小鼠命名，比如：敲除、敲入、点突变等等。

随机转基因的小鼠命名 基因定点修饰小鼠的命名 这一类小鼠的名称基本长这样： 下面我们对这些组成部分逐一说明~ 品系背景 如果是在单一的小鼠背景上完成的基因修饰，并且在繁育过程中未引入其它品系，那么就可以以品系全称来表示。

比如： 如果是在混合品系背景上，那么可以用这几个品系（<3个）缩写，并以分号作为间隔。

分号前表示受体，分号后表示供体。

比如：在一个来自C57BL/6与129杂交ES细胞系上定点敲除某个基因，就可以用B6;129表示。

直至这个品系与C57BL/6小鼠回交至近交系程度，那么可以改写为B6.129。

如果供体品系是混合背景或有未知来源，那么回交至受体品系的近交系程度后，可以用.Cg来表示，比如：B6.Cg。

如果存在3个以上祖系或有未知来源的混合遗传背景，那么以STOCK来表示。

被修饰的基因 这里的基因名用的是GeneSymbol。

GeneSymbol和GeneName到底有什么区别呢？ GeneSymbol有以下特点： 物种中唯一的 短，3-5个字母，最多不超过10个字母 只用罗马字母和阿拉伯数字 大写字母开头，后跟小写字母或数字 不包括组织特异性或分子量 最好跟GeneName的首字母一致 斜体表示 不同物种的同源基因使用相同的GeneSymbol GeneName则一般有以下特点： 简短，可以是几个单词，包含基因功能或特点 首字母小写（人名或专有名词除外） 使用美式拼写方法 举个例子你就明白啦，例如： Shh是GeneSymbol，而sonichedgehog则是它的GeneName。

所以，如果你想查找某个基因的敲除品系，那么最好输入GeneSymbol，而不是GeneName或者曾用名。

这里特别提一下定点过表达的这类情况： 目前最常用的两个定点过表达的整合位点，一个Rosa26位点，一个是H11位点。

Rosa26是一个基因，所以可以用它的GeneSymbol，也就是Gt(ROSA)26Sor。

H11并不是某一个特定基因，而是存在于两个基因之间的一个特定染色体位置，所以没有GeneSymbol。

目前公认的命名是Igs2，表示intergenicsite2的缩写。

修饰方式（上标） tm：对于ES细胞打靶途径获得品系，用tm表示targetedmutation。

em：对于CRISPR/Cas9或TALEN等核酸酶系统介导的基因修饰品系，用em表示endonuclease-mediatedmutation。

编号（上标） 这里的编号是指在该实验室中，对该基因修饰的序列号。

例如：Trp53tm1Holl表示在Holl实验室对Trp53基因进行的第一次突变。

有时候会看到tm1.1、tm1.2的情况，这是指条件性基因敲除（CKO）小鼠在与生殖系重组酶工具鼠交配后获得的子代小鼠品系，为了与亲代CKO小鼠（编号为tm1）区分。

而亲代CKO小鼠与其它组织特异性重组酶工具鼠交配的子代就不单独命名了。

插入结构（上标） 对于基因敲除和条件性基因敲除，在命名中一般不加入插入结构的部分，即编号后紧跟实验室代号。

例如：Trp53tm1Holl。

如果有敲入的基因，可以在括号内写出插入的外源基因。

例如：Cd19tm1(cre)Labcode表示在Cd19基因中敲入Cre基因。

如果敲入的是RNAi，那么把RNAi针对的靶点写进括号中。

例如：Genetm#(RNAi:Il23a)Labcode。

实验室代号（上标） 一般实验室代号是机构名称的首字母缩写。

比如： J表示TheJacksonLaboratory； Kyo代表KyotoUniversity； Smoc代表上海南方模式生物；等等。

随机转基因小鼠的命名 这一类小鼠的名称基本长这样，命名中Tg代表Transgene。

转入基因 在括号中填入转入的基因的启动子信息以及GeneSymbol。

编号 指该实验室制备的转基因founder编号或系列编号。

如果使用转座子系统来制备转基因小鼠的话，那么命名时在Tg后面加上Tn，表示transposableelement。

随后的括号内，一般需要包括：所使用的转座子系统缩写，以及构建的载体结构，两者用“-”链接：TgTn(transposon_class_abbreviation-vector)#Labcode。

例如：B6.Cg-TgTn(sb-lacZ,GFP)IF2Jtak/JtakRbrc，其中sb是sleepingbeauty的缩写。

知道了基因工程小鼠的命名规则，你可能又要问了，名字这么长总不能每次都写全名吧？确实，通常在文章中对所用的基因工程小鼠进行表述时，我们可以采用简写的方式。

具体可以怎么写呢？ 基因工程小鼠的一般简写方式 基因敲除 大家很熟悉了，可以分别用加、减号上标来表示wildtypeallele与mutantallele： KO纯合子Gene-/- KO杂合子Gene+/- 野生型对照Gene+/+或WT(wildtype) 基因敲入 将敲入的元件写在上标里，例如： Shh基因E177A点突变杂合子：ShhE177A/+ 如果Shh基因敲入报告基因或Cre重组酶基因，可以写成ShhEGFP/+，或者也可以直接写成Shh-EGFP、Shh-Cre。

转基因 一般直接写出表达的基因结构，例如： Villinpromoter驱动EGFP报告基因的转基因小鼠就可以表示为Vil-EGFP。

条件性基因敲除 将flox作为上标表示，比如： CKO纯合子Geneflox/flox或Genef/f CKO杂合子Geneflox/+或Genef/+ 如果与广泛表达Cre或生殖系表达Cre工具鼠交配后获得了全身敲除的小鼠，那么可以按KO小鼠的规则来简写。

如果与组织特异性Cre小鼠交配，那么可以组合写成：Geneflox/flox；Cre。

如果文章中只用到一种组织特异性Cre工具鼠，也可以按KO的方式简写，即Gene-/-可以表示flox纯合子且Cre阳性小鼠。

如果有多种不同的Cre，那么就需要分别表示了。

例如：Tlr5flox小鼠分别与小肠上皮细胞（IEC）特异性Cre（Vil-Cre）、DC细胞特异性Cre（CD11c-Cre）交配的子代中发生基因敲除的纯合子小鼠可以分别表示为Tlr5flox/flox；Vil-Cre和Tlr5flox/flox；CD11c-Cre。

如果觉得这样写太麻烦，也可以这样表示：Tlr5ΔIEC和Tlr5ΔDC。

关于基因工程小鼠的命名原则大致先介绍到这里，使用基因工程小鼠的过程中有任何问题，欢迎与我们沟通。

技术热线：400-728-0660 邮件咨询：[email protected] 国际业务：[email protected] 你也可能感兴趣 Tamoxifen诱导Cre-ERT2小鼠使用指南 Cre-ERT2在无Tamoxifen诱导的情况下，在细胞质内处于无活性状态；当Tamoxifen诱导后，Tamoxifen的代谢产物4-OHT（雌激素类似物）与ERT结合，可使Cre-ERT2进核发挥Cre重组酶活性。

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