記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響
文章推薦指數: 80 %
標題: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響. The memory effect on the noise decomposition during mRNA translation. 作者: 黃冠智
Skipnavigation
目前位置:國立陽明交通大學機構典藏
學術出版
畢業論文
標題: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響ThememoryeffectonthenoisedecompositionduringmRNAtranslation
作者: 黃冠智張正宏物理研究所
關鍵字: 噪聲;擾動;分解;fluctuation;noise
公開日期: 2013
摘要: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響
研究生:黃冠智指導教授:張正宏
國立交通大學物理研究所碩士班
中文摘要
在生活中處處存在著噪聲(noise),而如何分析這些噪聲的來源是相當重要的。
我們使用dual-reporters的方法將噪聲拆解成內部與外部噪聲,並分別以當下環境的狀態和環境的歷史為條件將mRNA轉譯成protein過程中的噪聲拆解,並利用variancenorm與KL_divergence來了解當下的protein與此不同時間之前mRNA的關聯。
由上述方法得知,在大部分的情況下,只考慮當下環境的狀態為條件做拆解時,並不能正確的拆解噪聲,而必須考慮所有環境的歷史才能精確的拆解內外噪聲,不過在特殊的狀況下:如在mRNA的耗散速率遠大於protein的耗散速率時,以當下環境的狀態就能得到相當好的拆解,且環境歷史的影響程度會因為在不同的速率常數下各不相同。
關鍵詞:擾動、噪音、分解ThememoryeffectonthenoisedecompositionduringmRNAtranslation
Student:Guan-Jhih,HuangAdvisor:Cheng-HungChang
InstituteofPhysics
NationalChiaoTungUniversity
ABSTRACT
Noisesareeverywhereinourlife.Howtoanalyzethesourcesofthesenoisesisveryimportant.Weusethedual-reportersmethodtoseparatenoisesintoextrinsicandintrinsicparts.WealsoseparatethenoisesinmRNAtranslation,byusingthepresentstateorotherhistoricalstatesoftheenvironment.ThenweanalyzetherelationbetweenthepresentstatusofproteinanddifferentlengthsofhistoryofmRNAbyusingthevariancenormandKLdivergence.Inmostofthesituations,wecannotseparatethenoisescorrectlybyusingtheconditiononthestatesofthepresentenvironment,Weneedtoconsiderthefullhistoriesoftheenvironmenttoseparatethenoisescorrectly.However,insomeparticularcases,likewhenthedissipationrateofmRNAisgreaterthanthatofprotein,wecanseparatethenoisescorrectlybythepresentstateoftheenvironment.Theeffectsofthehistoriesofenvironmentaredifferentindifferentrateconstants.
Keywords:Fluctuation,Noise
URI: http://140.113.39.130/cdrfb3/record/nctu/#GT070152738http://hdl.handle.net/11536/75083
顯示於類別:畢業論文
文件中的檔案:
存到雲端
273801.pdf
若為zip檔案,請下載檔案解壓縮後,用瀏覽器開啟資料夾中的index.html瀏覽全文。
IR@NYCUCrossRef漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG生化網路的內外噪聲物理分解/宋程硯;張正宏;Song,Cheng-Yan;Chang,Cheng-HungPowerandsubstratenoisetoleranceofconfigurableembeddedmemoriesinSoC/Chang,MF;Wen,KA奈米級靜態隨機存取記憶體之特性擾動及其壓抑技術/李典燁;Li,Tien-Yeh;李義明;Li,Yiming光在壓縮態下所產生光電流的變動/朱元隆;ChuYuenLong;孟心飛;MengHsinFeiProcess-andRandom-Dopant-InducedCharacteristicVariabilityofSRAMwithnano-CMOSandBulkFinFETDevices/Li,Tien-Yeh;Hwang,Chih-Hong;Li,Yiming鍺合金系列的非有序導致量子相變研究/許世英;SHIH-YINGHSULoading...
延伸文章資訊
- 1轉譯- 維基百科,自由的百科全書
轉譯(英語:Translation),是蛋白質生物合成(基因表達中的一部分,基因表達還包括轉錄)過程中的第一步。轉譯是根據遺傳密碼的中心法則,將成熟的mRNA分子(由DNA透過 ...
- 2【生物細胞】轉譯(translation)三劍客可以沒到齊,蛋白質 ...
這個研究結果,推翻了教科書上說的「轉譯一定要有tRNA、mRNA與核糖體才能進行」的結論。只能說,生物的世界是一個令人讚歎的世界,我們原本以為只能以DNA ...
- 3顛覆生醫創新的關鍵步驟– 體外轉錄
mRNA較為脆弱、容易被核糖核酸酶降解,因此mRNA合成的品質與穩定性成為應用的關鍵。mRNA的穩定與否則與五端加帽、三端加尾、非轉譯區的結構有關,近年 ...
- 4記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響
標題: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響. The memory effect on the noise decomposition during mRNA translation. 作...
- 5轉譯 - A+醫學百科
轉譯(translation)又稱「翻譯」,是生物按照從脫氧核糖核酸(DNA)轉錄得到的信使核糖核酸(mRNA)上的遺傳信息合成蛋白質的過程。即以信使核糖核酸為模板,合成具有 ...