記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響

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標題: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響. The memory effect on the noise decomposition during mRNA translation. 作者: 黃冠智 Skipnavigation 目前位置:國立陽明交通大學機構典藏 學術出版 畢業論文 標題: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響ThememoryeffectonthenoisedecompositionduringmRNAtranslation 作者: 黃冠智張正宏物理研究所 關鍵字: 噪聲;擾動;分解;fluctuation;noise 公開日期: 2013 摘要: 記憶效應對mRNA轉譯過程噪聲分解的影響 研究生:黃冠智指導教授:張正宏 國立交通大學物理研究所碩士班 中文摘要 在生活中處處存在著噪聲(noise),而如何分析這些噪聲的來源是相當重要的。

我們使用dual-reporters的方法將噪聲拆解成內部與外部噪聲,並分別以當下環境的狀態和環境的歷史為條件將mRNA轉譯成protein過程中的噪聲拆解,並利用variancenorm與KL_divergence來了解當下的protein與此不同時間之前mRNA的關聯。

由上述方法得知,在大部分的情況下,只考慮當下環境的狀態為條件做拆解時,並不能正確的拆解噪聲,而必須考慮所有環境的歷史才能精確的拆解內外噪聲,不過在特殊的狀況下:如在mRNA的耗散速率遠大於protein的耗散速率時,以當下環境的狀態就能得到相當好的拆解,且環境歷史的影響程度會因為在不同的速率常數下各不相同。

關鍵詞:擾動、噪音、分解ThememoryeffectonthenoisedecompositionduringmRNAtranslation Student:Guan-Jhih,HuangAdvisor:Cheng-HungChang InstituteofPhysics NationalChiaoTungUniversity ABSTRACT Noisesareeverywhereinourlife.Howtoanalyzethesourcesofthesenoisesisveryimportant.Weusethedual-reportersmethodtoseparatenoisesintoextrinsicandintrinsicparts.WealsoseparatethenoisesinmRNAtranslation,byusingthepresentstateorotherhistoricalstatesoftheenvironment.ThenweanalyzetherelationbetweenthepresentstatusofproteinanddifferentlengthsofhistoryofmRNAbyusingthevariancenormandKLdivergence.Inmostofthesituations,wecannotseparatethenoisescorrectlybyusingtheconditiononthestatesofthepresentenvironment,Weneedtoconsiderthefullhistoriesoftheenvironmenttoseparatethenoisescorrectly.However,insomeparticularcases,likewhenthedissipationrateofmRNAisgreaterthanthatofprotein,wecanseparatethenoisescorrectlybythepresentstateoftheenvironment.Theeffectsofthehistoriesofenvironmentaredifferentindifferentrateconstants. Keywords:Fluctuation,Noise URI: http://140.113.39.130/cdrfb3/record/nctu/#GT070152738http://hdl.handle.net/11536/75083 顯示於類別:畢業論文 文件中的檔案: 存到雲端 273801.pdf 若為zip檔案,請下載檔案解壓縮後,用瀏覽器開啟資料夾中的index.html瀏覽全文。

IR@NYCUCrossRef漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG漲落與微小生物系統/張正宏;CHANGCHENG-HUNG生化網路的內外噪聲物理分解/宋程硯;張正宏;Song,Cheng-Yan;Chang,Cheng-HungPowerandsubstratenoisetoleranceofconfigurableembeddedmemoriesinSoC/Chang,MF;Wen,KA奈米級靜態隨機存取記憶體之特性擾動及其壓抑技術/李典燁;Li,Tien-Yeh;李義明;Li,Yiming光在壓縮態下所產生光電流的變動/朱元隆;ChuYuenLong;孟心飛;MengHsinFeiProcess-andRandom-Dopant-InducedCharacteristicVariabilityofSRAMwithnano-CMOSandBulkFinFETDevices/Li,Tien-Yeh;Hwang,Chih-Hong;Li,Yiming鍺合金系列的非有序導致量子相變研究/許世英;SHIH-YINGHSULoading...



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