转运核糖核酸- 维基百科,自由的百科全书
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转运核糖核酸(Transfer RNA),又称傳送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称為tRNA,是一種由76-90個核苷酸所組成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附 ...
转运核糖核酸
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tRNA
tRNA的結構,其中黃色為3'端的CCA,紫色為接纳茎(acceptorstem),橘色為可變環(variableloop),紅色為D環(Darm),藍色為反密碼子環(Anticodonarm),綠色為T環(Tarm),
识别符
代号
tRNA
Rfam
RF00005
其他数据
RNA类型
tRNA
可用的PDB结构:
3icq,1asy,1asz,1il2,2tra,3tra,486d,1fir,1yfg,3eph,3epj,3epk,3epl,1efw,1c0a,2ake,2azx,2dr2,1f7u,1f7v,3foz,2hgp,2j00,2j02,2ow8,2v46,2v48,2wdg,2wdh,2wdk,2wdm,2wh1
转运核糖核酸(TransferRNA),又称傳送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称為tRNA,是一種由76-90個核苷酸所組成的RNA[1],其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定種類的氨基酸。
轉譯的過程中,tRNA可藉由自身的反密碼子識別mRNA上的密碼子,將該密碼子對應的氨基酸轉運至核糖體合成中的多肽鏈上。
每個tRNA分子理論上只能與一種氨基酸接附,但是遺傳密碼有简并性(degeneracy),使得有多於一個以上的tRNA可以跟一種氨基酸接附。
目录
1研究歷史
2tRNA的发现
3tRNA的結構
3.1特色
3.2氨酰化
4参阅
5參考資料
研究歷史[编辑]
在tRNA被發現以前,佛朗西斯·克里克就假設有種可以將RNA訊息轉換成蛋白質訊息的适配分子存在。
1960年代早期,亚历山大·里奇、唐納德·卡斯帕爾(英语:DonaldCaspar)等生物學家開始研究tRNA的結構[2],1965年,羅伯特·W·霍利首次分離了tRNA,並闡明了其序列與大致的結構[3],他因此貢獻而獲得1968年的諾貝爾生理學或醫學獎。
tRNA最早由羅伯特·M·博克(RobertM.Bock)成功結晶[4],之後陸續有人提出tRNA苜蓿葉狀的二級結構[5],此結構於1973年由金成鎬(英语:KimSung-Hou)與亚历山大·里奇的X射線繞射分析證實[6]。
另一个由阿龙·克卢格领导英国团队,在同一年发布同样的射线晶体学的发现。
tRNA的发现[编辑]
1955年Zamecnik认为标记的ATP可能参与RNA的生物合成。
于是他将14C标记的ATP与微粒体(Microsome)和细胞抽提液的可溶性部分一起保温后,发现RNA居然也被标记了。
他有点怀疑。
可是,当他将14C标记的氨基酸与微粒体和可溶性部分在同样条件下保温后,他惊奇地发现,与RNA合成无关的14C氨基酸也标记了RNA,而且更意想不到的是14C标记的RNA不是核糖体的大分子RNA,而是可溶性部分中的小分子RNA。
进一步,仅将可溶性部分与14C标记的氨基酸和ATP一起保温,则这种14C标记的氨基酸仍能与其中的小分子RNA结合。
因此,这种可溶性部分中的小分子RNA被称为称sRNA(solubleRNA)。
1956年Watson曾访问Zamecnik实验室,并对他们说,1955年Crick已经提出过“适配子”的设想。
后来,这种sRNA被命名为tRNA。
tRNA的結構[编辑]
來自酵母转运核糖核酸苯丙氨酸次級三葉草結構
tRNA的結構
tRNA為74~95個鹼基的小片段RNA鏈,會折疊成苜蓿葉狀的核酸二級結構,呈三叶草形,它由氨基酸臂、二氢尿嘧啶环、反密码环、额外环和TΨC环五部分组成。
tRNA有一级结构(5'到3'的核苷酸方向),二级结构(通常显示为三叶草结构)和三级结构(所有的tRNA具有类似L-形的三维结构,允许它们与核糖体的P、A位点结合)。
特色[编辑]
5'端磷酸。
受体臂(acceptstem,也被稱作aminoacidstem)是一個7個鹼基長的臂,其中包含5'端,與有3'端羟基(OH,能結合胺基酸於其上)的3'端。
受体臂有可能含有非Watson-Crick所發現的鹼基對。
CCA尾(CCAtail)是tRNA分子3'端的CCA序列,在翻译时,帮助酶识别tRNA。
D臂(Darm)是在一个环(Dloop)的端部4个碱基的臂,通常含有二氢尿嘧啶(dihydrouridine)。
反密码子臂(anticodonarm)有5个碱基,包括反密码子(anticodon)。
每一tRNA包括一个特异的三联反密码子序列,能够与氨基酸的一个或者多个密码子匹配。
例如赖氨酸(lysine)的密码子之一是AAA,相应的tRNA的反密码子可能是UUU(一些反密码子可以与多于一个的密码子匹配被称为“摆动”)。
T臂(Tarm)是5个碱基的茎,包括序列TψC。
修饰碱基(Modifiedbases)是tRNA中的一些不常见的碱基,如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修饰形式。
氨酰化[编辑]
参见:氨酰tRNA
氨酰化(Aminoacylation)是添加一个氨酰基团到化合物的过程。
在氨酰tRNA合成酶(aminoacyltRNAsynthetase)的作用下,tRNA与特异的氨基酸进行氨酰化反应(aminoacylated)。
对于一种氨基酸而言,尽管可能有多种tRNA和多种反密码子,但是通常只有一种氨酰tRNA合成酶。
合成酶对合适的tRNA的识别不仅仅是反密码子,受体臂也起了显著的作用[7]。
反应:
氨基酸+ATP→氨基酰-AMP+PPi
氨基酰-AMP+tRNA→氨基酰-tRNA+AMP
某些生物可能缺少一种或多种氨酰基tRNA合成酶。
这导致通过化学相关的氨基酸被氨酰化的tRNA,并且通过使用一种或多种酶,tRNA被修饰为正确的被氨酰化。
参阅[编辑]
生物主题
分子与细胞生物学主题
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信使核糖核酸(mRNA)
非編碼核糖核酸,和内含子
转运-信使核糖核酸(TmRNA)
翻譯(生物學)
搖擺鹼基對
氨酰tRNA
參考資料[编辑]
^Sharp,StephenJ;Schaack,Jerome;Cooley,Lynn;Burke,DeborahJ;Soll,Dieter.StructureandTranscriptionofEukaryotictRNAGenes.CRCCriticalReviewsinBiochemistry.1985,19(2):107–144.PMID 3905254.doi:10.3109/10409238509082541.
^BrianF.C.Clark.ThecrystalstructureoftRNA(PDF).J.Biosci.October2006,31(4):453–7[2018-09-27].PMID 17206065.doi:10.1007/BF02705184.(原始内容存档(PDF)于2011-01-01).
^HOLLEYRW;APGARJ;EVERETTGA;etal.STRUCTUREOFARIBONUCLEICACID.Science.March1965,147(3664):1462–5[2010-09-03].Bibcode:1965Sci...147.1462H.PMID 14263761.doi:10.1126/science.147.3664.1462.(原始内容存档于2019-09-25).
^Obituary.TheNewYorkTimes.1991-07-04.(原始内容存档于2021-04-30).
^TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1968.NobelFoundation.[2007-07-28].(原始内容存档于2007-07-06).
^KimSH;QuigleyGJ;SuddathFL;etal.Three-dimensionalstructureofyeastphenylalaninetransferRNA:foldingofthepolynucleotidechain.Science.1973,179(4070):285–8.Bibcode:1973Sci...179..285K.PMID 4566654.doi:10.1126/science.179.4070.285.
^SchimmelP,GiegéR,MorasD,YokoyamaS.AnoperationalRNAcodeforaminoacidsandpossiblerelationshiptogeneticcode.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.1993,90(19):8763–8.Bibcode:1993PNAS...90.8763S.PMC 47440 .PMID 7692438.doi:10.1073/pnas.90.19.8763.
查论编核酸种类组分
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核苷
核苷酸
寡核苷酸/多核苷酸(英语:polynucleotide)
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asRNA
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脱氧核糖核酸cDNA ·cpDNA ·gDNA ·Hachimoji ·msDNA ·mtDNA ·脱氧核酶核酸类似物(英语:Nucleicacidanalogue)
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