胡瓜嵌紋病毒M48RNA3核酸序列分析__臺灣博碩士論文知識加 ...
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為了更進一步探討病徵決定的相關序列, 利用cDNA選殖和雙去氧核酸定序法, 決定M48 RNA3核酸序列。
M48 RNA3的cDNA選殖分兩次進行, 首先以純化的RNA3為模板, ...
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論文基本資料
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本論文永久網址: 複製永久網址Twitter研究生:李美芳研究生(外文):LI,MEI-FANG論文名稱:胡瓜嵌紋病毒M48RNA3核酸序列分析論文名稱(外文):AnalysisofnucleotidesequenceofcucumbermosaicvirusM48RNA3指導教授:徐堯輝指導教授(外文):CHU,GIAO-HUI學位類別:碩士校院名稱:國立中興大學系所名稱:微生物研究所學門:生命科學學門學類:微生物學類論文種類:學術論文論文出版年:1990畢業學年度:78語文別:中文論文頁數:73中文關鍵詞:胡瓜嵌紋病毒、白化嵌紋病徵、核酸假重組、核酸外文關鍵詞:M48分離株、M48RNA3核酸序、RNA3、CUCUMBER-MOSAIC-VIRUS、PSEUDORECOMBINATION、MV相關次數:
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胡瓜嵌紋病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)屬於Tripartite植物病毒。
本地的M48分離株在菸草上(NicotianatabacumL.cv.Van-Hicks)為無病徵潛伏感染,而NT9分離株在相同寄主上,則引起白化嵌紋病徵。
本實驗室利用核酸假重組(Pseudor-ecombination)試驗,已証明RNA3決定M48與NT9截然不同的病徵表現。
為了更進一步探討病徵決定的相關序列,利用cDNA選殖和雙去氧核酸定序法,決定M48RNA3核酸序列。
M48RNA3的cDNA選殖分兩次進行,首先以純化的RNA3為模板,經Polyadenylation作用後,以Oligo(dT)為引子,合成雙股cDNA,然後選殖在質體pUEX1的B-amHI切位,轉形作用送至E.coliMC1061。
經由南方雜配(Southernhybridization)選擇一全長為1187個核酸的重組株,定名為MR3-21。
將cDNA片段切出並轉殖到M13mp18,進行核酸定序。
利用既得的序列,以DNA合成儀合成一段20個核酸的互補序列做為引子,在進行RNA3之5''端cDNA合成與選殖。
選擇一全長為1210個核酸的重組株,定名為MR3-172。
RNA3之5''端起點並經RNA定序決定。
M48RNA3全長為2205個核酸,包括兩段開啟讀碼架構(Openreadingframe,ORF),分別是含279個胺基酸的3A蛋白(分子量為30547daltons)以及有218個胺基酸的鞘蛋白(分子量為24195dalt-ons)。
5''非轉譯區、基因間區和3''非轉譯區各為111、295以及302個核酸。
比較CMV-Q、O、Y和Fny等系統之RNA3序列,M48和O、Y、Fny等的同源性都在89%以上,而M48和Q僅71%的同源性。
分別比較各部分構造,以3A蛋白同源性最高,而5''端非轉譯區之差異最大。
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